Ateneo - UPO

Il corso si propone di fornire allo studente una base solida nelle simulazioni computerizzate di entità chimiche, come proteine e molecole. Inoltre, l'insegnamento mira a fornire conoscenze fondamentali sui metodi chimico-fisici utilizzati nello studio di sistemi biotecnologici di interesse farmaceutico. Sarà introdotta anche un'introduzione teorico-pratica alla bioinformatica e alla systems biology, con un focus sull'applicazione di metodi omici nella ricerca biomedica, in particolare nella farmacogenomica. Il corso coprirà anche i principi delle tecniche analitiche utilizzate nella proteomica e nella metabolomica, inclusi gli indici di prestazione dei metodi analitici e i principi dell'uso di strumentazione come la cromatografia liquida e gas accoppiata alla spettrometria di massa. Saranno illustrate le differenze tra approccio "targeted" e "untargeted" e le strategie per scegliere l'approccio analitico più adatto a un problema pratico. Infine, gli studenti saranno guidati nella ricerca bibliografica e avranno l'opportunità di risolvere un caso studio proposto dal docente.

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Conoscenze: Il corso si propone di fornire agli studenti conoscenze fondamentali sui metodi di simulazione computerizzata per sistemi chimici e biologici. Ciò include tecniche computazionali per il calcolo delle energie e delle geometrie molecolari, nonché l'analisi conformazionale di molecole piccole e macromolecole.
Applicazione delle Conoscenze: Gli studenti svilupperanno la capacità di applicare le loro conoscenze per risolvere problemi chimici e biologici proposti durante il corso. Acquisiranno inoltre competenze nell'utilizzo di software di modellazione di base per prevedere la struttura delle proteine e le interazioni farmaco-recettore.
Conoscenze e Comprensione: Il corso si concentra sullo sviluppo di una solida comprensione delle proprietà fisico-chimiche alla base dei metodi utilizzati nei sistemi biotecnologici, biologici e farmaceutici. Gli studenti impareranno a valutare e selezionare i metodi chimici e fisici appropriati per lo studio di sistemi specifici. Acquisiranno inoltre competenze di comunicazione, inclusa l'uso di un vocabolario pertinente. Inoltre, impareranno ad analizzare in modo critico la letteratura e i casi studio.

Conoscenze di base in biologia molecolare, genetica, chimica generale ed inorganica, matematica e fisica.

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L'esame riguarderà il contenuto dei moduli. Il voto finale sarà assegnato dalla commissione d'esame.

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Al termine del corso, gli studenti avranno acquisito una solida comprensione degli aspetti fondamentali necessari per condurre simulazioni accurate delle strutture chimico-biologiche.
Gli studenti saranno in grado di applicare la conoscenza dei principali metodi chimico-fisici utilizzati nello studio di sistemi di interesse biotecnologico e farmaceutico, valutandone le potenzialità e l'applicabilità.
Sarà richiesta ai partecipanti la conoscenza di strumenti bioinformatici di base per lo studio del genoma umano, in particolare nell'ambito biomedico e farmacogenomico. Saranno in grado di comprendere in modo autonomo e critico il contenuto di articoli di ricerca riguardanti argomenti e risultati bioinformatici e di biologia dei sistemi.
Gli studenti acquisiranno conoscenze teoriche e pratiche sulle tecniche di analisi più moderne nel campo omico (cromatografia liquida e gas, spettrometria di massa) e sui metodi di pretrattamento e analisi dei campioni omici. Saranno in grado di confrontare diverse tecniche analitiche e di scegliere il metodo migliore per risolvere un caso studio.
Inoltre, svilupperanno abilità comunicative utilizzando un vocabolario appropriato in relazione agli argomenti del corso e saranno in grado di organizzare e presentare un caso studio attraverso una presentazione in formato PowerPoint. Infine, svilupperanno autonomia di giudizio nel selezionare tra diverse tecniche per raggiungere uno stesso obiettivo.