Ateneo - UPO

I segnali extracellulari e i recettori di membrana. Le vie di trasduzione del segnale. Regolazione trascrizionale e traduzionale.
Introduzione alle tecniche di sequenziamento massivo (NGS) e loro applicazioni.
Lettura critica di articoli scientifici relativi agli argomenti trattati durante il corso.

Amaldi, Benedetti, Pesole, Plevani. Tecniche e metodi per la biologia molecolare. Casa Editrice Ambrosiana.
Amaldi,Benedetti, Pesole, Plevani. Biologia Molecolare. Terza edizione. Casa Editrice Ambrosiana.
Alberts, Johnson, Lewis, Morgan, Raff, Roberts, Walter. Biologia molecolare della cellula. Sesta edizione. Zanichelli

Studio dei meccanismi molecolari alla base della trasduzione del segnale, della trascrizione e della sintesi proteica. introduzione alle metodiche bioinformatiche.

Biologia Molecolare I, Biochimica, Genetica.

Lezioni frontali, discussione articoli scientifici.

Controllo dell'apprendimento:
in itinere vengono assegnate letture di approfondimento e/o domande che successivamente vengono discusse in aula.

L'esame consiste in una prova orale. Le domande verteranno su tutti gli argomenti trattati durante le lezioni. Durante l'esame non è consentito l'uso di testi né di appunti.

Fondamenti di biologia molecolare: DNA, cromosomi e genomi; struttura e funzione del DNA; struttura e funzione della cromatina; i cromosomi; l’evoluzione dei genomi. Replicazione, riparazione e ricombinazione del DNA. La versatilità dell’RNA; i genomi ad RNA. Le proteine: struttura e funzione.
Segnalazione cellulare: principi generali; segnalazione tramite recettori accoppiati alle proteine G; segnalazione tramite recettori accoppiati ad enzimi; vie di segnalazione alternative nella regolazione genica; segnalazione nei vegetali. Le vie di segnalazione nella cellula neoplastica. Le neoplasie: meccanismi molecolari dei processi di invasione e metastasi. Focus sulle proteine RAS. Biologia molecolare dell’adenocarcinoma del colon e del polmone. Biopsia liquida e DNA circolante (cfDNA e ctDNA)
Le tecnologie del DNA ricombinante tra passato e futuro. Tecniche e piattaforme di sequenziamento, NGS, applicazioni. Sequenziamento de novo e risequenziamento di genomi completi; identificazione di siti polimorfici e mutazioni; studio del grado di accessibilità della cromatina; determinazione dell’organizzazione spaziale della cromatina; analisi del trascrittoma. Editing del genoma: le nucleasi ZFN e TALEN; il sistema CRISPR/Cas9. Organismi geneticamente modificati.
RNA regolatori nei procarioti; RNA regolatori negli eucarioti; Regolazione della trascrizione: I microRNA; Regolazione dei microRNA; Meccanismi di RNA interference nella cellula.
Organizzazione di un laboratorio di biologia molecolare. Linee guida.

Conoscenza dei principali meccanismi di trasduzione del segnale e dei meccaniscmi di regolazione genica a livello post trascizionale.
Conoscenza delle tecniche di sequenziamento (NGS) e delle loro applicazioni. Conoscenza dei principi di analisi dei dati NGS. Non è richiesto essere in grado svolgere le analisi ma di conoscerne i principi.