Ateneo - UPO

Il corso fornisce alle studentesse e agli studenti conoscenze sulla struttura e funzione delle comunità microbiche e in particolare sul microbiota intestinale umano. Verranno descritte le principali metodologie impiegate per lo studio e l’analisi del microbiota.

Non sono richiesti libri di testo. Tutto il materiale didattico utilizzato per le lezioni frontali (presentazioni ppt, articoli scientifici e reviews) verrà reso disponibile agli studenti sulla piattaforma DIR

Il corso si propone di insegnare alle studentesse e agli studenti l’importanza di studiare i genomi delle comunità microbiche presenti nel nostro organismo al fine di comprenderne la loro diversità, funzionalità e il loro impatto sulla nostra salute. Si forniranno inoltre gli strumenti per la comprensione delle metodologie impiegate in questa disciplina, dal next generation sequencing (NGS) all’analisi bioinformatica dei dati.

Le studentesse e gli studenti devono avere una conoscenza di base della biologia molecolare e della genetica.

Lezioni frontali mediante presentazioni PowerPoint su schermo. Lettura, discussione e presentazione di articoli scientifici in aula.

Il controllo dell'apprendimento verrà effettuato mediante discussione collegiale degli argomenti trattati
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti- disabili-e-dsa
Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.

Esame orale. La prova orale prevede alcune domande sui principali argomenti del programma e/o la discussione di articoli scientifici presentati durante il corso. Per il superamento della verifica lo studente deve dimostrare di conoscere e di aver compreso i concetti fondamentali della materia di studio e di essere in grado di esporli in modo comprensibile e scientificamente corretto.

Introduzione alla metagenomica. Microbioma e microbiota. The Human Microbiome Project. Alfa e beta diversità. Il microbiota intestinale umano: composizione, origine e variazioni. Funzioni del microbiota intestinale: protezione verso i patogeni e funzioni metaboliche. Il microbiota e l’asse intestino-cervello.
La disbiosi intestinale nell’invecchiamento, nelle malattie metaboliche (obesità e diabete di tipo 2) e nelle malattie neurologiche e neurodegenerative (depressione, autismo e malattia di Alzheimer).
Descrizione delle principali piattaforme di Next Generation Sequencing (Illumina e Nanopore) e delle loro applicazioni nella ricerca biomedica e nella medicina personalizzata.
Sequenziamento rRNA 16S per l’analisi del microbioma: vantaggi e svantaggi Sequenziamento Shotgun per l’analisi del microbioma: vantaggi e svantaggi. Overview dei principali strumenti bioinformatici per l’analisi dei dati di metagenomica
Cenni di metatrascrittomica
Presentazione e discussione di articoli scientifici relativi alla metagenomica

Comprendere l’importanza della metagenomica per rilevare la diversità genetica e tassonomica delle comunità microbiche, con particolare riferimento al microbiota intestinale umano e alle sue possibili implicazioni sulla salute. Conoscere le tecniche di sequenziamento high-throughput, quelle di analisi dei dati e, teoricamente, saperle applicare.
Abilità comunicative: capacità di esporre gli argomenti del corso in modo chiaro e comprensibile e con l’uso della corretta terminologia scientifica.
Capacità di apprendimento: approfondire le proprie conoscenze della metagenomica sulle pubblicazioni scientifiche, per seguire con atteggiamento critico l'avanzamento della disciplina.