Ateneo - UPO

Il corso riguarda lo studio di tecniche molecolari per analisi applicate all'ecologia quali trascrittomica differenziale, proteomica, DNA e RNA bacroding, metagenomica.

An Introduction to Ecological Genomics
Second Edition
Nico M. van Straalen and Dick Roelofs. Oxford University Press. ISBN-13: 9780199594689

Il docente incoraggia la lettura di testi specialistici, tra cui:
Assessments and Conservation of Biological Diversity from Coral Reefs to the Deep Sea
Uncovering Buried Treasures and the Value of the Benthos
1st Edition - November 30, 2023
Author: Jose Victor Lopez
Language: English
Paperback ISBN: 9780128241127

L’insegnamento ha l’obiettivo di fornire agli/alle studenti/esse le basi teoriche e applicative dell’ecologia molecolare per l’analisi della biodiversità, delle interazioni biotiche e degli impatti antropici sugli ecosistemi. Attraverso lezioni frontali, seminari e un workshop sperimentale, il corso sviluppa competenze avanzate nell’uso di tecniche omiche (trascrittomica, metagenomica, DNA/RNA barcoding) e nell’interpretazione dei dati molecolari in chiave ecologica. Il corso mira inoltre a far acquisire strumenti critici per la valutazione delle alterazioni ambientali e dei meccanismi che le governano, integrando l’approccio sperimentale con l’analisi della letteratura scientifica.

E’ necessaria una buona conoscenza dei fondamenti di base della biologia cellulare e molecolare.

Lezioni frontali; lettura, analisi e discussione guidata di articoli scientifici; attività seminariali svolte da esperti esterni; laboratorio sperimentale di ecologia molecolare; workshop individuale di progettazione sperimentale con formulazione dell’ipotesi, esecuzione degli esperimenti, analisi dei dati e confronto con la letteratura.

Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati
rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-
disabili-e-dsa. Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.

Test in itinere; discussioni orali durante le lezioni; esercitazioni guidate; relazione sulle attività di laboratorio. L’esame finale consiste in uno scritto (essay scientifico di 5–6 pagine comprensivo della parte sperimentale del workshop) e in una prova orale articolata in almeno tre domande sui macro-argomenti del corso. La valutazione considera: accuratezza delle conoscenze, capacità di collegamento tra i contenuti, uso corretto della terminologia scientifica, analisi critica dei dati e qualità della comunicazione orale e scritta. La sufficienza è raggiunta con la conoscenza degli elementi fondamentali e la comprensione della logica dei metodi analitici.

Tecniche e applicazione di trascrittomica per l'ambiente.
Tecniche e applicazione del sequenziamento di acidi nucleici per l'ambiente.
Laboratorio di ecologia molecolare.
Worshop pratico: attività di active learning, ricerca bibliografica, scrittura creativa, DNA barcoding, analisi e visualizzazione dei dati.
Integrazione della dimensione di genere: Uno sguardo trasversale alla determinazione sessuale attraverso l'albero della vita: un approccio molecolare

Descrittore di Dublino 1 — Conoscenza e capacità di comprensione
Al termine dell’insegnamento lo/la studente/essa conosce i fondamenti teorici e gli sviluppi avanzati dell’ecologia molecolare, con particolare riferimento alle tecniche omiche applicate allo studio degli ecosistemi (trascrittomica, metagenomica, DNA/RNA barcoding, proteomica). Comprende i meccanismi molecolari alla base delle risposte degli organismi e delle comunità biologiche alle pressioni antropiche a livello globale e locale e possiede gli elementi teorici dell’ecotossicologia molecolare.

Descrittore di Dublino 2 — Capacità di applicare conoscenza e comprensione
Lo/la studente/essa è in grado di applicare le tecniche omiche illustrate durante il corso per analizzare dati molecolari in ambito ecologico, orientarsi tra i principali pipeline bioinformatici e interpretarne criticamente l’output. Utilizza protocolli sperimentali di ecologia molecolare per formulare e testare ipotesi, condurre esperimenti nel workshop di laboratorio, elaborare i dati ottenuti e confrontarli con la letteratura scientifica.

Descrittore di Dublino 3 — Autonomia di giudizio
Lo/la studente/essa integra e valuta criticamente dati sperimentali e informazioni scientifiche provenienti dalla letteratura internazionale, distinguendo tra evidenze robuste e dati preliminari. È in grado di interpretare le implicazioni ecologiche e ambientali dei risultati ottenuti applicando un approccio autonomo e rigoroso.

Descrittore di Dublino 4 — Abilità comunicative
Lo/la studente/essa comunica risultati scientifici in forma scritta e orale con proprietà di linguaggio, utilizzando la terminologia specifica della biologia molecolare ed ecologica. Presenta e discute dati, grafici e interpretazioni sia durante il workshop sia nell’elaborato scritto, dimostrando capacità di argomentazione coerente e supportata da fonti.

Descrittore di Dublino 5 — Capacità di apprendimento
Lo/la studente/essa acquisisce la capacità di aggiornarsi autonomamente sugli sviluppi dell’ecologia molecolare tramite la consultazione e l’analisi critica della letteratura scientifica in lingua inglese. È in grado di apprendere nuove metodiche, integrare competenze omiche emergenti e trasferirle alla comprensione di problematiche ecologiche complesse.