Pharmaceutical Biotechnologies

Academic program

×
Print
Course
Struttura, proprietà e ingegnerizzazione di biomolecole
Course ID
FA0303
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MIGGIANO RICCARDO
Teachers
Miggiano Riccardo, Digilio Giuseppe
CFU
13.0
Teaching duration (hours)
104.0
Individual study time
0.0
SSD
BIO/10 - BIOCHIMICA, CHIM/03 - CHIMICA GENERALE E INORGANICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
I contenuti del corso includono i principi teorici della scienza delle proteine e le eventuali ricadute applicative e possono essere riassunti come segue: i) principi fondamentali e nozioni di base della biochimica delle proteine e dell'ingegneria proteica; i) metodi chimico-fisici per l'analisi dell'interazione proteina-proteina e proteina-ligando con un modulo dedicato alle tecniche di risonanza magnetica nucleare (NMR); ii) elementi di biologia strutturale e tecniche di indagine associate (cristallografia a raggi-X, crio-microscopia elettronica ed NMR).
The contents of the course include the theoretical principles of protein science and any applicative implications and can be summarized as follows: i) fundamental principles and basic notions of protein biochemistry and protein engineering; i) physico-chemical methods for the analysis of protein-protein and protein-ligand interactions with a module dedicated to nuclear magnetic resonance (NMR) techniques; ii) elements of structural biology and associated investigative techniques (X-ray crystallography, cryo-electron microscopy and NMR).
Testi di riferimento/Textbooks
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules
Obiettivi formativi/Mission
Il corso mira a fornire allo studente un approfondimento dei fondamenti della biochimica delle proteine con particolare attenzione alle relazioni struttura-funzione delle macromolecole biologiche, alla biologia strutturale e ai metodi biofisici per la caratterizzazione delle proteine includendo le tecniche spettroscopia NMR applicata alle biomolecole.
The course aims to provide the student with an in-depth study of the fundamentals of protein biochemistry with particular attention to the structure-function relationships of biological macromolecules, structural biology and biophysical methods for protein characterization including NMR spectroscopy techniques applied to biomolecules.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di chimica generale, chimica organica, fisica, chimica-fisica e biochimica delle proteine.
Basic knowledge of chemistry, organic chemistry, physics, physical chemistry and biochemistry of proteins.
Metodi didattici/Teaching methods
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules
Altre informazioni/Further information
"Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti- disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services- students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame consisterà in una prova orale per il modulo di scienza delle proteine e una prova scritta per il modulo NMR biomolecolare. Il voto finale sarà assegnato dalla commissione d'esame. Per il modulo relativo alla scienza delle proteine le domande saranno mirate a valutare la preparazione dello studente nella descrizione dei concetti teorici di base delle tecnologie presentante durante il corso e nella comprensione delle loro potenzialità applicative. L'eccellenza si raggiunge quando lo studente dimostra di avere una conoscenza critica dei concetti presentati nel corso. Per il modulo relativo a NMR biomolecolare l'esame scritto (due ore di tempo) conterrà: i) n. 2 domande a risposta multipla sugli aspetti teorici; ii) n. 4 domande aperte sull' interpretazione di spettri NMR; iii) n. 1 esercizio di interpretazione spettrale, dove sarà richiesto di trovare la struttura di una semplice molecola organica sulla base di dati 1D/2D NMR. Alla fine del corso verrà messo a disposizione degli studenti un testo di esame tipico.
The exam will consist of an oral exam for the protein science module and a written exam for the biomolecular NMR module. The final grade will be assigned by the examining commission. For the protein science module the questions will aim at evaluating the student's preparation in describing the basic theoretical concepts of the technologies presented during the course and in understanding their application potential. Excellence is achieved when the student proves to have a critical knowledge of the concepts presented in the course. For biomolecular NMR the written exam (two hours) consists of: i) n. 2 multiple choice questions on fundamental theoretical aspects; ii) n. 4 open questions about the interpretation of NMR spectra; iii) one spectral problem where the student is asked to work out the chemical structure of a simple organic compound from 1D/2D NMR spectra. A sample exam text will be made available to the students.
Programma esteso/Content
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Lo studente dovrà essere in grado di argomentare e discutere i princìpi di base relativi alla reattività delle macromolecole biologiche e la relazione struttura funzione delle proteine. Dovrà inoltre saper conoscere le tecniche di riferimento per la caratterizzazione biochimica e strutturale delle macromolecole biologiche e delle loro interazioni sviluppando abilità comunicative e autonomia di giudizio su tutti gli argomenti trattati nel corso.
The student must be able to argue and discuss the basic principles relating to the reactivity of biological macromolecules and the structure-function relationship of proteins. They will also have to know the reference techniques for the biochemical and structural characterization of biological macromolecules and their interactions, developing communication skills and independent judgment on all the topics covered in the course.
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
FA0304Scienza delle proteine BIO/10 - BIOCHIMICA Miggiano Riccardo Not available
FA0305NMR biomolecolare CHIM/03 - CHIMICA GENERALE E INORGANICA Digilio Giuseppe Not available
Show parent course details
×
Print
Course
Struttura, proprietà e ingegnerizzazione di biomolecole: Scienza delle proteine
Course ID
FA0304
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MIGGIANO RICCARDO
Teachers
Miggiano Riccardo
CFU
10.0
Teaching duration (hours)
80.0
Individual study time
170.0
SSD
BIO/10 - BIOCHIMICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso è suddiviso in due moduli. La prima parte del primo modulo prevede una sezione introduttiva di livellamento dove verranno riproposti principi e nozioni base delle proteine e degli enzimi, loro proprietà e funzioni e principi fondamentali. La seconda parte verrà articolata illustrando i metodi principali per lo studio e l’analisi delle proteine con un approfondimento sulle techiche per l’indagine strutturale (principalmente diffrattometria a raggi X e nozioni di criomicroscopia elettronica). Nella terza parte verranno presentati e discussi principi base del drug design e dell’ingegneria proteica su base razionale. In questa parte del corso verranno presentate e discusse pubblicazioni scientifiche rilevanti e maggiormente rappresentative dei risvolti applicativi della scienza delle proteine. Nella secondo modulo verranno affrontati i princìpi di base dell'ingegneria proteica e le relative tecniche di riferimento. Verranno inoltre discussi i metodi chimico-fisici per lo studio delle proteine e delle interazioni proteina-proteina e proteina-ligando.
The course is divided into two modules. The first part of the first module provides an introductory leveling section where basic principles and notions of proteins and enzymes, their properties and functions will be discussed. The second part will descibe the main methods for the study and analysis of proteins with an in-depth analysis of the techniques for structural investigation (mainly X-ray diffraction and notions of electron cryomicroscopy). In the third part, basic principles of drug design and protein engineering on a rational basis will be presented and discussed. Moreover, scientific publications relevant and more representative of the application aspects of protein science will be presented and discussed. In the second module, the basic principles of protein engineering and the related reference techniques will be addressed. The physical-chemical methods for the study of protein-protein and protein-ligand molecular interactions will also be discussed.
Testi di riferimento/Textbooks
DonaldVoet, Judith G Voet, Charlotte W Pratt. PRINCIPIDI BIOCHIMICA, 2017. Zanichelli. Introduzione allo studio delle proteine. Duranti; Zanichelli Donald Voet, Judith G Voet, Charlotte W Pratt. FONDAMENTI DI BIOCHIMICA. IVedizione, 2017. Zanichelli David L Nelson, Michael M Cox. PRINCIPI DI BIOCHIMICA DI LEHNINGER. VII edizione, 2018. Zanichelli     Mike Williamson. "Come funzionano le proteine" Edizione Italiana a cura di Martino Bolognesi, 2020. Zanichelli.
DonaldVoet, Judith G Voet, Charlotte W Pratt. PRINCIPIDI BIOCHIMICA, 2017. Zanichelli. Introduzione allo studio delle proteine. Duranti; Zanichelli Donald Voet, Judith G Voet, Charlotte W Pratt. FONDAMENTI DI BIOCHIMICA. IVedizione, 2017. Zanichelli David L Nelson, Michael M Cox. PRINCIPI DI BIOCHIMICA DI LEHNINGER. VII edizione, 2018. Zanichelli     Mike Williamson. "Come funzionano le proteine" Edizione Italiana a cura di Martino Bolognesi, 2020. Zanichelli.
Obiettivi formativi/Mission
Il corso fornisce allo studente un approfondimento dei fondamenti della biochimica delle proteine acquisiti nel corso della laurea di primo livello, con particolare attenzione alle relazioni struttura-funzione delle macromolecole biologiche, alla biologia strutturale e ai metodi biofisici per la caratterizzazione delle proteine.
The course provides the student with an in-depth study of the fundamentals of protein biochemistry acquired during the first level degree, with particular attention to the structure-function relationships of biological macromolecules, structural biology and biophysical methods for the characterization of proteins.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di chimica generale, chimica organica, fisica e biochimica.
Basic knowledge of general chemistry, organic chemistry, physics and biochemistry.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione frontale mediante la proiezione di diapositive, e proiezione di filmati. Esecuzione in aula di problemi e quiz, discussioni sui dati presenti in letteratura. Gli studenti potranno inoltre utilizzare i libri di testo consigliati per approfondire gli argomenti discussi in aula.
Lesson ex-cathedra with the slides presentation, and movies. Execution of problems and quizzes in the classroom, discussion on literature data. Students can also use the recommended textbooks to deepen the topics discussed in the classroom
Altre informazioni/Further information
Durante il corso saranno effettuate delle verifiche di apprendimento in itinere.
In itinere test will be carried out during the course.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Vedere la scheda dell’insegnamento generale.
See the description of the general course.
Programma esteso/Content
NOZIONI GENERALI SULLE PROTEINE - Amminoacidi e proteine: proprietà chimiche e strutturali - Legame peptidico e livelli strutturali delle proteine - Proteine come molecole informazionali: analisi di sequenze e database TECNICHE DI INDAGINE DELLE PROTEINE - Nozioni di biologia strutturale: tecniche spettroscopiche e diffrattometriche per l’indagine strutturale delle proteine - Programmi di visualizzazione di proteine - Predizione strutturale delle proteine - Modelling molecolare “CASE STUDIES” E RISVOLTI APPLICATIVI DELLA SCIENZA DELLE PROTEINE - Scienza delle proteine e drug design: principi, esempi e discussione di pubblicazioni scientifiche - Scienze delle proteine e ingegneria proteica: principi, esempi e discussione di pubblicazioni scientifiche INGEGNERIA PROTEICA - Introduzione alla produzione di proteine ricombinanti - Tecniche di clonaggio e vettori di espressione - Mutagenesi sito-diretta e random mutagenesi - Proteine chimeriche - Rational protein design: principi teorici e metodi sperimentali - Selezione e valutazione di varianti proteiche di interesse: saggi biochimici e analisi delle proprietà desiderate. METODI CHIMICO-FISICI PER LO STUDIO DELLE PROTEINE -Tecniche cromatografiche per la purificazione di proteine - Salting in/out. - Metodi per la valutazione della concentrazione e della purezza delle proteine. - Metodi per la valutazione della stabilità e del ripiegamento delle proteine: - Fluorimetria a scansione differenziale e calorimetria a scansione differenziale - Dicroismo circolare - “Light-Scattering” per lo studio della struttura quaternaria delle proteine - Metodi per la valutazione delle interazioni molecolari proteina-proteina, proteina-ligando: - Calorimetria isotermica di titolazione - Risonanza plasmonica di superficie - Termoforesi di microscala
Basic principles of protein science: -Amino acids and proteins: chemical and structural properties -Peptide bond and protein structure -Proteins as information molecules: sequence and database analysis Structural analysis techniques: Structural biology: spectroscopic and diffrattometric techniques for structural protein investigation Protein visualization programs Structural protein prediction Molecular modelling "Case studies" and application implications of Protein Science: -Protein science and drug design: principles, examples and discussion of scientific publications -Protein Sciences and Protein Engineering: Principles, Examples and discussion of scientific publications PROTEIN ENGINEERING - Introduction to the production of recombinant proteins - Cloning techniques and expression vectors - Site-directed and random mutagenesis - Chimeric proteins - Rational protein design: theoretical principles and experimental methods - Selection and evaluation of protein variants: biochemical assays and desired property analysis. CHEMICAL-PHYSICAL METHODS FOR PROTEIN ANALYSIS: -Chromatographic techniques for protein purification - Salting in/out. - Methods for assessing the concentration and purity of proteins. Methods for assessing protein stability and folding: - Differential scanning fluormetry and differential scanning calorimetry - Circular dicroism - "Light-Scattering" for the study of the quaternary structure of proteins -Methods for the analysis of protein-protein and protein-ligand interactions: - Isothermal titration calorimetry - Surface plasmon resonance - Microscale thermophoresis
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Lo studente dovrà essere in grado di argomentare e discutere i princìpi di base relativi alla reattività delle macromolecole biologiche e la relazione struttura funzione delle proteine. Dovrà inoltre saper conoscere le tecniche di riferimento per la caratterizzazione biochimica e strutturale delle macromolecole biologiche.
The student should be able to argue and discuss the basic principles of the reactivity of biological macromolecules and the structure-function relationship of proteins. The student should also know the reference techniques for the biochemical and structural characterization of biological macromolecules.
Show parent course details
×
Print
Course
Struttura, proprietà e ingegnerizzazione di biomolecole: NMR biomolecolare
Course ID
FA0305
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
DIGILIO GIUSEPPE
Teachers
Digilio Giuseppe
CFU
3.0
Teaching duration (hours)
24.0
Individual study time
51.0
SSD
CHIM/03 - CHIMICA GENERALE E INORGANICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Questo modulo tratta l’applicazione di tecniche di risonanza magnetica nucleare (NMR) in biologia strutturale, con particolare riferimento allo studio delle interazioni proteina ligando. Il modulo inizia introducendo i concetti fondamentali della spettroscopia 1D/2D NMR e la loro applicazione per l'analisi di spettri NMR di piccole biomolecole/farmaci. A seguire verranno introdotte le tecniche NMR utilizzate per lo studio di peptidi e proteine. In particolare, saranno illustrati: i) il metodo sequenza-specifico per l’assegnazione completa del backbone proteico; ii) i metodi per la determinazione strutturale di biomolecole; iii) i metodi per lo studio delle interazioni proteina/ligando.
This course is about the application of Nuclear Magnetic Resonance (NMR) techniques in structural biology, including the study of protein/ligand interactions. The course starts by introducing the fundamental concepts of 1D/2D NMR spectroscopy and their application to the analysis of the NMR spectra of small biomolecules/drugs. Then, the basic NMR techniques used to study peptides and proteins will be introduced, namely: i) the sequence-specific method for the assignment of the protein backbone; ii) methods to determine the three-dimensional structure of peptides and proteins from NMR-derived data; and iii) methods to study protein/ligand interactions.
Testi di riferimento/Textbooks
Il materiale didattico e le dispense a cura del docente sono integralmente disponibili sulla piattaforma online. Consigliati inoltre: • A. Randazzo “Guida Pratica alla Interpretazione di Spettri NMR”, Loghia, 2018, ISBN-8895122429. • T.D.W. Claridge “High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry”, 3rd Ed, 2006, Elsevier (in lingua inglese) • Joseph. P. Hornak “The Basics of NMR” 1997-2004. http://www.cis.rit.edu/htbooks/nmr/ (testo online, disponibile anche in italiano)
The lecturer will provide all slides and exercises discussed during the course. Suggested textbooks: • A. Randazzo “Guida Pratica alla Interpretazione di Spettri NMR”, Loghia, 2018, ISBN-8895122429. • T.D.W. Claridge “High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry”, 3rd Ed, 2006, Elsevier (in English) • Joseph. P. Hornak “The Basics of NMR” 1997-2004. http://www.cis.rit.edu/htbooks/nmr/ (online book)
Obiettivi formativi/Mission
- Fornire solide basi dei principi della spettroscopia NMR applicata alle biomolecole; - Fornire alle studentesse ed agli studenti gli strumenti necessari per l' interpretazione di spettri NMR e dei dati relativi alle interazioni proteina/ligando; - Creare consapevolezza circa le possibilità (e le limitazioni) della tecnica NMR per la determinazione della struttura tridimensionale di peptidi e proteine; - Acquisire e saper utilizzare un lessico appropriato in relazione agli argomenti affrontati nel corso; - Sviluppare la capacità di apprendere autonomamente per approfondire gli argomenti trattati.
- To provide the students with basic concepts of biomolecular NMR; - To provide the students with conceptual tools enabling the interpretation of NMR spectra and of protein/ligand interaction data; - To create awareness about the potential (and limitations) of NMR spectroscopy in regards to the resolution of the three-dimensional structure of biomolecules; - To provide the students with a suitable technical vocabulary in relation to the topics described in the course; - To foster the capacity of autonomous further learning.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di Chimica Organica, Chimica Fisica (spettroscopia) e Biochimica (struttura delle proteine).
Students have to be familiar with basic concepts in Organic Chemistry, Physical Chemistry (spectroscopy) and Biochemistry (protein structure).
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali in aula integrate con esercitazioni interattive di interpretazione spettrale. I concetti oggetto del corso verranno discussi in aula e applicati durante le esercitazioni di interpretazione spettrale, per verificare il livello di apprendimento in tempo reale.
Classroom lectures integrated with exercises about spectral interpretation. The main topics of the course will be discussed collectively in the classroom and the knowledge will be applied to work out spectral interpretation problems, to assess the level of understanding in real time.
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities . Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Alla fine del modulo ci sarà un esame scritto (durata 2 ore) contenente sia domande aperte che chiuse ed un esercizio di interpretazione spettrale (trovare la struttura di un composto organico usando spettri 1H e 13C-NMR e spettri di tipo 2D-NMR). Sarà reso disponibile un tipico testo di esame. La votazione conseguita in questo modulo farà media pesata con il voto conseguito nell'altro modulo del corso.
At the conclusion of this module, students will undertake a written examination lasting two hours. The exam will comprise both open-ended and multiple-choice questions, as well as a practical spectral interpretation task. This exercise will require students to determine the structure of an organic compound using ¹H and ¹³C-NMR spectra, in addition to 2D-NMR techniques. A sample exam paper will be provided to aid in preparation. The mark awarded for this module will be weighted and averaged with the mark obtained in the other module within the course.
Programma esteso/Content
Metodi spettroscopici di Risonanza Magnetica Nucleare per lo studio della struttura di biomolecole e delle interazioni proteina/ligando. - Principi di NMR: nuclei in un campo magnetico; popolazione dei livelli energetici di spin nucleare; frequenza di precessione di Larmor; magnetizzazione macroscopica; condizione di risonanza; NMR multinucleare. - Spettroscopia NMR ad impulsi (FT-NMR): modello vettoriale; sistema di coordinate rotanti; impulsi di radiofrequenza; angolo di impulso; Free Induction Decay (FID); dominio tempo e dominio frequenza; trasformata di Fourier (FT); sequenze di impulsi. - Parametri NMR: spostamento chimico; accoppiamento scalare; area del segnale; spettroscopia 1H e 13C-NMR; esercizi di assegnazione ed interpretazione spettrale. - Il rilassamento nucleare: rilassamento longitudinale (T1) e trasversale (T2); accoppiamento dipolare; regimi di moto molecolare ed effetti sul rilassamento nucleare; effetto Overhauser nucleare (NOE); misura di distanze internucleari basata su NOE. - Lo scambio chimico: regime di scambio (lento, intermedio, veloce) ed effetti dello scambio sul segnale NMR e sulle velocità di rilassamento nucleare; equilibrio di formazione del complesso bimolecolare proteina/ligando come sistema in scambio chimico; metodi per lo studio dell'interazione proteina/ligando basati sull'osservazione del ligando; saturation transfer difference (STD) NMR; Group Epitope Mapping (GEM), water-LOGSY; misura delle costanti di affinità. - Spettroscopia 2D-NMR: spettri 2D-COSY, 2D-TOCSY, 2D-NOESY e 2D-HSQC; esercizi di assegnazione ed interpretazione spettrale basati su spettri 2D-NMR. - Tecniche NMR multidimensionali per la determinazione strutturale di polipeptidi: assegnazione sequenza specifica del backbone proteico; principi ed applicazioni per l’acquisizione di vincoli strutturali da misure NOE; cenni di calcolo strutturale. - Metodi per lo studio di interazioni proteina ligando basati sull'osservazione della proteina: spettri 2D 1H,15N-HSQC di proteine; Chemical Shift Perturbation mapping; SAR by NMR.
NMR methods to assess the three dimensional structure of proteins and to study protein/ligand interactions. - Basic concepts of NMR: nuclear spins; nuclei in a magnetic field; nuclear spin energy levels and populations; Larmor frequency; macroscopic magnetization; the resonance condition; multinuclear NMR. - Pulse (FT) NMR: the vector model of NMR; rotating frame; radiofrequency pulses; flip angle; Free Induction Decay (FID); time and frequency domains; Fourier transform (FT); pulse sequences. - The NMR spectrum: chemical shift; scalar coupling; signal area; 1H and 13C-NMR spectroscopy; problems and exercises about the interpretation of 1D NMR spectra. - Nuclear relaxation: longitudinal relaxation (T1); transverse relaxation (T2); dipolar coupling; molecular motions and their effect on nuclear relaxation; the nuclear Overhauser effect (NOE) and internuclear distances. - Chemical exchange: exchange regimes (slow, intermediate, fast); effects of chemical exchange on the NMR spectrum and on nuclear relaxation; the protein/ligand association equilibrium as a chemical exchange process; methods to study protein/ligands interactione based on the observation of the ligand; Saturation Transfer Difference (STD) NMR; Group Epitope Mapping (GEM); water-LOGSY; measurement of dissociation constants; NMR screening in drug discovery. - 2D-NMR spectroscopy: 2D-COSY, 2D-TOCSY, 2D-NOESY and 2D-HSQC spectra; examples and exercises about the interpretation of 2D NMR spectra. - Multidimensional NMR techniques to assess the three-dimensional structure of peptides and proteins: the sequence-specific assignment method; NOE-based methods to measure internuclear distances; elements of molecular dynamics calculations. - Methods to study protein/ligand interactions based on the observation of the protein: 2D 1H,15N-HSQC spectra; Chemical Shift Perturbation (CSP) mapping; SAR by NMR.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
-Conoscenza e comprensione delle basi teoriche della spettroscopia NMR, delle tecniche NMR di base per la determinazione strutturale di biomolecole e per lo studio delle interazioni proteina/ligando. -Capacità di applicare conoscenza e comprensione all' interpretazione di spettri NMR (capacità di assegnare e/o predire spettri di molecole semplici) ed all'uso di dati NMR per la caratterizzazione delle interazioni proteina/ligando. -Autonomia di giudizio: capacità di valutare con senso critico le possibilità ed i limiti delle tecniche NMR nella caratterizzazione strutturale e dinamica di biomolecole. -Abilità comunicative: acquisizione di proprietà di linguaggio che consenta di presentare i risultati scientifici di uno studio NMR biomolecolare in maniera rigorosa, chiara e concisa. -Capacità di apprendimento: capacità di utilizzare il materiale didattico e le fonti bibliografiche per approfondire in maniera autonoma aspetti specifici della spettroscopia NMR applicata allo studio di proteine e delle loro interazioni con ligandi
-Basic knowledge and understanding of: i) the theoretical principles of NMR spectroscopy; ii) the NMR techniques for the determination of protein structure; and iii) the NMR techniques to study protein/ligand interactions. -Ability to apply knowledge and understanding to: i) the interpretation of NMR spectra (spectral assignment and/or prediction of simple molecules spectra); and ii) the use of NMR data to study protein/ligand interactions. -Autonomy of judgment: ability to evaluate critically the possibilities and the limitations of NMR techniques to assess the structure and dynamics of biomolecules and protein/ligand complexes. - Communication skills: acquisition of technical language and vocabolary enabling to present an NMR study in a clear, rigorous, and concise manner. - Learning skills: ability to use educational resources and literature references, in an autonomous manner, to gain further insights into specific NMR techniques for the assessment of protein structure and interaction with ligands.
×
Print
Course
Farmaci biotecnologici e vaccini: dal disegno alla commercializzazione
Course ID
FA0306
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
TRON Gian Cesare
Teachers
D'angelo Igor Edmondo Paolo, Pessolano Emanuela, Tron Gian Cesare
CFU
7.0
Teaching duration (hours)
56.0
Individual study time
0.0
SSD
BIO/14 - FARMACOLOGIA, CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
italiano
italian
Contenuti/Content Summary
Il corso in questione si propone di fornire agli studenti gli strumenti necessari per comprendere e approfondire le caratteristiche, l'ambito di applicazione, le metodologie, il percorso e le problematiche legate al disegno, allo sviluppo, alla produzione e all'utilizzo di farmaci biotecnologici e vaccini. In particolare, si focalizzerà anche sugli approcci di nuova generazione utilizzati in questo settore. Inoltre, il corso affronterà i processi connessi alla scoperta, all'ottimizzazione e alla validazione di peptidi e peptidomimetici, considerando anche la loro attività biologica. Questo permetterà agli studenti di acquisire una conoscenza approfondita delle strategie e delle tecniche utilizzate per lo sviluppo di molecole con potenziali utilizzi terapeutici o biotecnologici. Il corso mira quindi a fornire una visione globale degli aspetti teorici e pratici legati a questi due ambiti di ricerca, integrando nozioni di base con approfondimenti sulle nuove tendenze e tecnologie emergenti. Gli studenti saranno in grado di acquisire competenze specifiche per affrontare le sfide e le opportunità che caratterizzano tali settori, sia nella ricerca scientifica che nell'industria farmaceutica e biotecnologica.
The course in question aims to provide students with the necessary tools to understand and explore the characteristics, scope of application, methodologies, processes, and issues related to the design, development, production, and use of biotechnological drugs and vaccines. In particular, it will also focus on next-generation approaches used in this field. Additionally, the course will address the processes involved in the discovery, optimization, and validation of peptides and peptidomimetics, considering their biological activity. This will enable students to acquire a comprehensive knowledge of the strategies and techniques used for the development of molecules with potential therapeutic or biotechnological applications. Therefore, the course aims to provide a comprehensive overview of the theoretical and practical aspects related to these two research areas, integrating basic knowledge with insights into emerging trends and technologies. Students will be able to acquire specific skills to tackle the challenges and opportunities that characterize these sectors, both in scientific research and in the pharmaceutical and biotechnology industry.
Testi di riferimento/Textbooks
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules
Obiettivi formativi/Mission
Il seguente corso offre un'ampia panoramica sul percorso della ricerca e sviluppo di farmaci biotecnologici e vaccini, illustrando le diverse fasi, dalla concezione all'approvazione. Inoltre, presenta gli obiettivi principali del corso di Ricerca e sviluppo farmaceutico di farmaci peptidici e peptidomimetici, che mira a fornire agli studenti una comprensione fondamentale della chimica farmaceutica di queste molecole e delle strategie per la loro progettazione. Alla fine del corso, gli studenti acquisiranno le conoscenze e le competenze necessarie per sviluppare peptidomimetici, comprendendo le sfide coinvolte nel loro sviluppo.
The following course provides a comprehensive overview of the research and development process for biotechnological drugs and vaccines, outlining the different phases from conception to approval. Additionally, it presents the main objectives of the Pharmaceutical Research and Development course for peptide and peptidomimetic drugs, aiming to provide students with a fundamental understanding of the pharmaceutical chemistry of these molecules and the strategies for their design. By the end of the course, students will acquire the knowledge and skills necessary to develop peptidomimetics, understanding the challenges involved in their development.
Prerequisiti/Required background knowledge
chimica organica
chimica organica
Metodi didattici/Teaching methods
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules.
Altre informazioni/Further information
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame sarà composto da due prove relative ai due moduli del corso (vedere le schede dei singoli moduli per i dettagli). Il voto finale sarà calcolato come media non pesata sul numero di crediti di ciascun corso.
The exam will consist of two tests relating to the two course modules (see the description of the individual modules.). The final grade will be calculated as a non-weighted average according to the number of credits of each course
Programma esteso/Content
Vedere le schede dei singoli moduli
See the description of the individual modules.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Questo corso fornirà agli studenti un'approfondita conoscenza sul percorso di ricerca e sviluppo di farmaci biotecnologici già in uso. Gli studenti impareranno ad applicare le conoscenze acquisite per comprendere e proporre nuovi bersagli e il conseguente disegno e studio di farmaci innovativi. Inoltre, il corso coprirà gli aspetti fondamentali riguardanti la chimica farmaceutica dei peptidi e peptidomimetici. Gli studenti saranno in grado di presentare, discutere e far comprendere le strategie generali per la progettazione dei peptidi e peptidomimetici. Al termine del corso, gli studenti avranno acquisito una solida base di conoscenza sui farmaci biotecnologici e sulla chimica farmaceutica dei peptidi, che li renderà pronti ad affrontare sfide nel settore della ricerca e dello sviluppo di farmaci.
This course will provide students with in-depth knowledge of the research and development process of biotechnological drugs already in use. Students will learn to apply the acquired knowledge to understand and propose new targets and the subsequent design and study of innovative drugs. Additionally, the course will cover fundamental aspects regarding the pharmaceutical chemistry of peptides and peptide mimetics. Students will be able to present, discuss, and comprehend general strategies for the design of peptides and peptide mimetics. By the end of the course, students will have acquired a solid knowledge base of biotechnological drugs and pharmaceutical chemistry of peptides, making them ready to tackle challenges in the field of drug research and development.
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
FA0307Ricerca e sviluppo: aspetti farmacologici BIO/14 - FARMACOLOGIA D'angelo Igor Edmondo Paolo, Pessolano Emanuela Not available
FA0308Ricerca e sviluppo farmaceutico di farmaci peptidici e peptidomimetici CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA Tron Gian Cesare Not available
Show parent course details
×
Print
Course
Farmaci biotecnologici e vaccini: dal disegno alla commercializzazione: Ricerca e sviluppo: aspetti farmacologici
Course ID
FA0307
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
PESSOLANO Emanuela
Teachers
D'angelo Igor Edmondo Paolo, Pessolano Emanuela
CFU
5.0
Teaching duration (hours)
40.0
Individual study time
85.0
SSD
BIO/14 - FARMACOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso intende fornire allo studente gli strumenti per conoscere e comprendere le proprietà, l’ambito di applicazione, le metodologie, il percorso e le problematiche inerenti il disegno, lo sviluppo, la produzione, inclusi gli approcci di nuova generazione, e l’utilizzo dei farmaci biotecnologici e di vaccini.
The course aims to provide the student with the tools to know and understand the properties, the scope, the methodologies, the path and the problems involved in the design, development, production and use of biotechnological drugs and vaccines, including the new generation approaches.
Testi di riferimento/Textbooks
Materiale fornito a lezione; letteratura scientifica
Handsout distributed in the classroom; scientific literature
Obiettivi formativi/Mission
Illustrare allo studente l'intero percorso della ricerca e sviluppo, dalla ideazione all'approvazione, di varie classi di farmaci biotecnologici e dei vaccini.
To make sure that the student knows the entire research and development process, from conception to approval, of various classes of biotechnological drugs and vaccines.
Metodi didattici/Teaching methods
Alle lezioni tradizionali in aula verranno affiancati seminari e testimonianze di esperti del settore, e lavori di gruppo finalizzati ad esercitare negli studenti la capacità di fare ricerche bibliografiche mirate, estrarre e analizzare criticamente informazioni rilevanti, e presentare proprie idee progettuali. Nel caso di una nuova emergenza COVId le lezioni verranno svolte in remoto, registrate e caricate su DIR. Su richiesta degli studenti e/o periodicamente la piattaforma Google MEET verrà utilizzata per rispondere a domande/richieste di chiarimento.
The traditional classroom lessons will be accompanied by seminars from industry experts and group-work aimed at exercising students' ability to perform targeted bibliographic research, critically extract and analyze relevant information, and present their own project ideas. If the case of a new COVID19 emergency, the lessons will be carried out by recording and uploading them on Youtube or on DIR. Periodically and/or upon student request, question time will be organized on Google meet.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame consiste in una discussione orale di 20-30 minuti nella quale allo studente vengono posti quesiti su alcuni argomenti del programma e si valuta la sua capacità di argomentare, di collegare logicamente tra loro concetti e conoscenze, di comunicare in modo efficace e chiaro, usando una terminologia appropriata.
The final exam consists in a 20-30 min discussion on selected course topics and will be mainly aimed at evaluating the ability of the students to prove not only their knowledge but also their ability to logically connect concepts, their problem solving ability and their communication skills, together with the use of appropriate terminology.
Programma esteso/Content
Principali applicazioni cliniche per farmaci biotecnologici. Proprietà farmacodinamiche, farmacocinetiche, profilo di tollerabilità, eventi avversi delle principali classi di farmaci biotecnologici. Esempi di ingegnerizzazione di farmaci biotecnologici per migliorarne le caratteristiche farmacocinetiche e/o farmacodinamiche. Discussione di case studies relativi al disegno e sviluppo di proteine terapeutiche, anticorpi monoclonali, DNA/RNA come farmaci, vaccini.
Main clinical and diagnostic applications of biotechnological drugs. Pharmacodynamic, pharmacokinetic, tolerability profile, adverse events of biotech drugs with examples from different therapeutic areas. Examples of molecular engineering approaches to improve pharmacokinetic and / or pharmacodynamic and/or immunogenicity of relevant biotech drugs. Discussion of selected examples of discovery and development of therapeutic proteins, Mabs, DNA/RNA based drugs and vaccines.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso lo studente avrà approfondite conoscenze sul percorso di ricerca e sviluppo di farmaci biotecnologici già in uso e sarà in grado di applicare le conoscenze acquisite per comprendere e proporre nuovi bersagli e il conseguente disegno e studio di farmaci innovativi
At the end of the course the student will have in-depth knowledge of the research and development path of biotechnological drugs already in use and will be able to apply the knowledge acquired to understand and propose the identification of new targets and the consequent design and study of innovative drugs.
Show parent course details
×
Print
Course
Farmaci biotecnologici e vaccini: dal disegno alla commercializzazione: Ricerca e sviluppo farmaceutico di farmaci peptidici e peptidomimetici
Course ID
FA0308
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
TRON Gian Cesare
Teachers
Tron Gian Cesare
CFU
2.0
Teaching duration (hours)
16.0
Individual study time
34.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso si occuperà dei processi inerenti la scoperta, l’ottimizzazione e la validazione di peptidi e peptidomimetici con attività biologica
The course will deal with the processes inherent the discovery, optimization and validation of peptides and peptidomimetics with biological activity
Testi di riferimento/Textbooks
Peptidomimetics in organic and medicinal chemistry , Wiley Ed, Trabocchi, Guarna Peptidi e peptidomimetici, Piccon Ed., Santagata, Caliendo
Peptidomimetics in organic and medicinal chemistry , Wiley Ed, Trabocchi, Guarna Peptidi e peptidomimetici, Piccon Ed., Santagata, Caliendo
Obiettivi formativi/Mission
Gli obiettivi del corso di Ricerca e sviluppo farmaceutico di farmaci peptidici e peptidomimetici sono quelli di introdurre lo studente agli aspetti fondamentali riguardanti la chimica farmaceutica dei peptidi e peptidomimetici e nel contempo presentare, discutere e far comprendere le strategie generali per la loro progettazione. Alla fine del corso lo studente avrà acquisito le necessarie conoscenze e abilità riguardo la progettazione dei peptidomimetici, comprendendo le problematiche relative al loro sviluppo.
The goals of the course are to introduce students to the key topics relating to medicinal chemistry of peptides and peptidomimetics and at the same time present and discuss general strategies for their drug design. At the end of the course, the student will have gained the essential stock of knowledge with regard to the drug design and the issues relating to their development.
Prerequisiti/Required background knowledge
chimica organica
organic chemistry
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso prevede lezioni frontali in aula con proiezione di diapositive. Nel caso di una nuova emergenza COVID19, le lezioni verranno svolte registrandole e caricandole su Youtube con link nel corso su DIR. A richiesta, verranno organizzati question time su Google meet.
The course consists of lectures with slides show. If the case of a new COVID19 emergency, the lessons will be carried out by recording and uploading them on Youtube with links in the course on DIR. Upon request, question time will be organized on Google meet.
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
ENG: Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
La valutazione dell’apprendimento consiste in una prova scritta a domande aperte. Le domande coprono tutti gli argomenti trattatati durante le lezioni di didattica frontale.
The learning assessment consists of a written examination. The questions cover all the topics which have been discussed during the lessons.
Programma esteso/Content
Gli amminoacidi. Chiralità degli amminoacidi. Proprietà acido-basiche degli amminoacidi. Come far reagire gli amminoacidi. Strutture secondarie dei peptidi Peptidi naturali. Peptidi come farmaci. Peptidi stabili per os. Peptidi stabili termicamente e chimicamente. Sintesi chimica dei peptidi. Gruppi protettori degli amminoacidi. Metodi di coupling. Il problema della racemizzazione. Chemical ligation. Sintesi peptidica in fase solida. Chimica combinatoriale di peptidi. Purificazione di proteine. Come migliorare la druglikeness di un peptide. Pseudpeptidi. Peptidomimetici.
Amino acids. Amino acids chirality. Acid and basic properties of amino acids. How to react amino acids? Peptides secondary structures. Natural peptides. Peptides as drugs. Orally available peptides. Peptides thermically stable. Chemical synthesis of peptides. Protecting groups of peptides. Coupling methods. The problem of racemization. Chemical ligation. Solid phase of peptides. Combinatorial chemistry of peptides. Purification of peptides. How to improve the druglikeness of a peptide. Pseudopetides. Peptidomimetics.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Le studentesse e gli studenti al termine del corso avrà appreso gli aspetti fondamentali riguardanti la chimica farmaceutica dei peptidi e peptidomimetici e nel contempo sarà in grado di presentare, discutere e far comprendere le strategie generali per la loro progettazione.
The students at the end of the course will know the key topics relating to medicinal chemistry of peptides and peptidomimetics and at the same time they will be able to present and discuss the general strategies for their drug design.
×
Print
Course
Dal target al lead (I)
Course ID
FA0294
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
DISTASI Carla
Teachers
Distasi Carla, Tapella Laura Paola Ferilde, Lim Dmitry, Pinton Giulia, Porta Chiara, Consonni Francesca Maria
CFU
15.0
Teaching duration (hours)
112.0
Individual study time
0.0
SSD
BIO/09 - FISIOLOGIA, BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA, MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso offre un approfondimento dei meccanismi molecolari alla base della fisiologia cellulare e molecolare, della patogenesi delle principali malattie immuno-mediate, degli approcci di immunoterapia in ambito oncologico e dello sviluppo di terapie a bersaglio molecolare
The course offers an in-depth study of the molecular mechanism of cellular and molecular physiology, the pathogenesis of the principal immune-modulated diseases, immunotherapy approaches for cancer, and the development of molecular target-based therapy
Testi di riferimento/Textbooks
Per i testi di riferimento vedere le schede dei singoli moduli
For reference texts see individual module sheets
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di approfondire la conoscenza della biofisica e della fisiologia molecolare e cellulare, dei meccanismi molecolari d'azione dei farmaci a bersaglio molecolare e di acquisire e comprendere i target verso cui sono diretti i farmaci innovativi biotecnologici attualmente utilizzati per la cura dei tumori e delle principali malattie immuno-mediate. Gli studenti saranno in grado di esporre, con appropriato linguaggio scientifico, i contenuti del corso in modo logico e completo, effettuando collegamenti tra i vari argomenti e di applicare le conoscenze acquisite per sviluppare farmaci biotecnologici innovativi.
The course aims to deepen the knowledge of biophysics, molecular and cellular physiology, and of the molecular mechanism responsible for molecular target based-drug, and to understand the novel biotechnological based-drug therapy for cancer and immune-dependent diseases. The students will learn and use the appropriate scientific words for complete and logical communication of the different topics of the course, also making correlations and, based on the acquired information, developing biotechnological drugs.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di matematica e statistica, fisica, biochimica, biologia cellulare e molecolare
Fundamentals of mathematics, statistics, physics, biochemistry, cellular and molecular biology, physiology and immunology
Metodi didattici/Teaching methods
Vedere le schede dei singoli moduli
See individual module sheets
Altre informazioni/Further information
Vedere le schede dei singoli moduli.
See individual module sheets
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame sarà orale e riguarderà il contenuto dei moduli. Il voto finale sarà assegnato collegialmente dalla commissione d'esame.
Oral exam on the course contents. The evaluation will be held by the exam commission.
Programma esteso/Content
Vedere le schede dei singoli moduli
See individual module sheets
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso lo studente avrà approfondito la conoscenza della biofisica dei fenomeni bioelettrici e della fisiologia cellulare e molecolare, dell'immunologia e dell'oncologia molecolare, nonché delle vie di trasduzione del segnale generato dall'interazione farmaco/ e il suo bersaglio. Sarà quindi in grado di applicare queste competenze in campo farmacologico/biotecnologico per lo sviluppo di nuove strategie terapeutiche. Infine lo studente sarà capace di divulgare le conoscenze acquisite con proprietà lessicali specifiche
At the end of the course, the students will learn in detail the biophysics of bioelectric phenomena and the cellular and molecular physiology, the immunology, and the molecular oncology, as well as the downstream pathway based on drug-target interaction/binding. Then, the students will apply their competences in pharmaceutical and biotecnological fields to develop novel terapeutic strategies and to communicate them with properly scientific language.
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
FA0295Fisiologia e biofisica applicata BIO/09 - FISIOLOGIA Distasi Carla, Tapella Laura Paola Ferilde, Lim Dmitry Not available
FA0296Meccanismi molecolari alla base dello sviluppo di terapie mirate BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA Pinton Giulia Not available
FA0297Target innovativi in oncologia e malattie immunomediate MED/04 - PATOLOGIA GENERALE Porta Chiara, Consonni Francesca Maria Not available
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (I): Fisiologia e biofisica applicata
Course ID
FA0295
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
DISTASI Carla
Teachers
Distasi Carla, Tapella Laura Paola Ferilde, Lim Dmitry
CFU
5.0
Teaching duration (hours)
32.0
Individual study time
81.0
SSD
BIO/09 - FISIOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso offre un approfondimento dei meccanismi molecolari alla base delle funzioni fisiologiche, quali la trasmissione nervosa e la segnalazione cellulare, illustrando le moderne tecniche indagine nell’ambito della biofisica di membrana e della fisiologia molecolare e cellulare. Le lezioni saranno integrate da attività di laboratorio.
The course offers an in-depth analysis of the molecular mechanisms underlying physiological functions, such as nerve and synaptic transmission and cellular signaling, illustrating state-of-the-art techniques in the field of membrane biophysics and molecular and cellular physiology. The lectures are complemented by laboratory activities.
Testi di riferimento/Textbooks
G. Aicardi, V. Carabelli, E. Carbone, R. Maggi. Fisiologia: dalle molecole ai sistemi integrati (terza edizione). EdiSES, 2025. ISBN 9788836232308. Ion Channels of Excitable Membranes. Bertil Hille, Sinauer Associates Inc. 2001 I testi consigliati saranno integrati con ulteriore materiale indicato dai docenti nel corso delle lezioni
G. Aicardi, V. Carabelli, E. Carbone, R. Maggi. Fisiologia: dalle molecole ai sistemi integrati (terza edizione). EdiSES, 2025. ISBN 9788836232308. Ion Channels of Excitable Membranes. Bertil Hille, Sinauer Associates Inc. 2001 The recommended texts will be integrated with additional material indicated during the lectures
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di approfondire la conoscenza della biofisica e della fisiologia molecolare e cellulare con particolare riferimento al sistema nervoso. Le studentesse e gli studenti acquisiranno le conoscenze e la capacità di comprensione dei meccanismi associati ai processi di trasporto, ai fenomeni bioelettrici di membrana e alla segnalazione cellulare. Saranno in grado di esporre, con appropriato linguaggio scientifico, i contenuti del corso in modo logico e completo, effettuando collegamenti tra i vari argomenti e di applicare le conoscenze acquisite in ambito farmacologico e tecnologico.
The course aims to acquire and deepen the knowledge of biophysics and molecular and cellular physiology with particular reference to the nervous system. Students will acquire the understanding of the mechanisms associated with transport processes, membrane bioelectric phenomena and cell signaling. They will be able to describe and illustrate, with appropriate scientific language, the contents of the course in a logical and complete manner, being able to make connections between the various topics and to apply the acquired knowledge in the fields of pharmacology and pharmaceutic technology.
Prerequisiti/Required background knowledge
Le studentesse e gli studenti devono possedere le conoscenze di base di matematica e statistica, fisica, biochimica, biologia molecolare e fisiologia.
Students must have basic knowledge of mathematics and statistics, physics, biochemistry, molecular biology and physiology.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni teoriche e esercitazioni di laboratorio. In caso di emergenza COVID-19, le lezioni e le esercitazioni saranno tenute in modalità telematica, nei tempi e nelle modalità concordate con i coordinatori dei corsi di studio
Theoretical lectures and laboratory exercises. In case of the COVID-19 emergency, the lessons will be held at a distance using e-learning technologies, according to the schedule and modality indicated by the administration.
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Vedere la scheda dell’insegnamento generale.
see teaching overview sheet
Programma esteso/Content
Fenomeni bioelettrici. Processi di trasporto. Struttura e proprietà biofisiche dei canali ionici. Proprietà dello stato stazionario della membrana. Proprietà di conduzione delle cellule. Eccitabilità della membrana. Canali ionici, potenziale di membrana e ciclo cellulare. Omeostasi del pH intracellulare. Canali ionici come bersagli molecolari dei farmaci. Canalopatie. Tecniche di indagine dei fenomeni bioelettrici e applicazioni nello sviluppo di nuovi farmaci. Lo ione calcio come secondo messaggero. L'omeostasi cellulare del calcio. Il "calcium signaling toolkit" come bersaglio farmacologico. Tecniche e sonde per misurare le dinamiche e le concentrazioni del calcio nei diversi distretti intracellulari. Utilizzo dei sensori per il calcio per lo sviluppo e screening dei farmaci. Le cellule del sistema nervoso. Ruolo omeostatico delle cellule gliali. Interazione glia-neurone e le sue alterazioni nelle malattie neurologiche e neurodegenerative. Applicazioni per lo sviluppo delle strategie terapeutiche L'attività di laboratorio comprenderà la realizzazione e l'analisi di esperimenti di imaging del calcio su singola cellula e un laboratorio virtuale di elettrofisiologia.
Bioelectric phenomena. Processes of transport across the plasma membrane. Biophysical structure and properties of ion channels. Steady state properties of the membrane. Conduction properties of cells. Membrane excitability. Ionic channels, membrane potential and cell cycle. Intracellular pH homeostasis. Ionic channels as drugs targets. Channelopathies. Techniques used to investigate bioelectric phenomena and applications in drug screening and development field. The calcium ion as the second messenger. Intracellular calcium homeostasis. Calcium signaling toolkit as a pharmacological target. Techniques and probes for measuring the dynamics and concentrations of calcium in the various intracellular compartments. Use of calcium sensors in drug development and screening technologies. The cells of the nervous system. Homeostatic role of glial cells. Glia-neuron interaction and its alterations in neurological and neurodegenerative diseases. Applications for the development of diagnostic, preventive and therapeutic strategies Laboratory activity will include the implementation and analysis of calcium imaging experiments on single cell and a virtual laboratory of electrophysiology.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso la studentessa/lo studente avrà approfondito la conoscenza della biofisica dei fenomeni bioelettrici e della fisiologia cellulare e molecolare nonché degli aspetti teorici e pratici delle metodologie disponibili per la ricerca sperimentale in tali ambiti. Sarà quindi in grado di applicare queste competenze in campo farmacologico per lo sviluppo di nuove strategie terapeutiche. Tali risultati di apprendimento attesi, declinati in accordo con i descrittori di Dublino, sono: CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE Dimostrare conoscenze avanzate di biofisica e fisiologia molecolare e cellulare. Comprendere i meccanismi alla base del trasporto di membrana, dei fenomeni bioelettrici e della segnalazione cellulare. CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE Applicare le conoscenze teoriche per analizzare e interpretare processi fisiologici complessi. Risolvere problemi in ambito biomedico e farmacologico AUTONOMIA DI GIUDIZIO Valutare in modo critico dati sperimentali e modelli teorici in biofisica e fisiologia. Integrare conoscenze provenienti da diversi ambiti per formulare giudizi autonomi e consapevoli in contesti accademici o applicati. ABILITÀ COMUNICATIVE Comunicare concetti scientifici in modo chiaro e coerente, utilizzando una terminologia appropriata. Presentare e discutere gli argomenti del corso in modo logico, evidenziando collegamenti tra i diversi temi trattati. CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO Sviluppare strategie di apprendimento autonome per l’ampliamento continuo delle conoscenze. Prepararsi a studi avanzati o ad attività di ricerca nei campi delle neuroscienze, della farmacologia o delle scienze biomediche
By the end of the course the students will have deepened their knowledge of the biophysics of bioelectrical phenomena and of cellular and molecular physiology as well as of the theoretical and practical aspects of the state-of-the-art methodologies experimental research in these areas. They will be able to apply the acquired skills for the development of new therapeutic strategies. These expected learning outcomes, defined in line with the Dublin Descriptors, are: KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING. Demonstrate advanced knowledge in biophysics and molecular and cellular physiology, with a specific focus on the nervous system. Understanding the mechanisms underlying membrane transport, bioelectrical phenomena, and cellular signaling. APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING Apply theoretical knowledge to analyze and interpret complex physiological processes. Solving problems in biomedical and pharmacological fields. MAKING JUDGEMENTS Critically evaluate experimental data and theoretical models in biophysics and physiology. Integrate knowledge from multiple domains to make informed and autonomous judgments in academic or applied contexts. COMMUNICATION SKILLS Communicate scientific concepts clearly and coherently using appropriate terminology. Present and discuss course topics logically, demonstrating the ability to link different subject areas. LEARNING SKILLS Develop autonomous learning strategies for continuous knowledge enhancement. Prepare for advanced study or research in neuroscience, pharmacology, or biomedical sciences.
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (I): Meccanismi molecolari alla base dello sviluppo di terapie mirate
Course ID
FA0296
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
PINTON GIULIA
Teachers
Pinton Giulia
CFU
5.0
Teaching duration (hours)
40.0
Individual study time
85.0
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso offre un approfondimento dei meccanismi molecolari alla base dello sviluppo di terapie a bersaglio molecolare.
The course offers an in-depth analysis of the molecular mechanisms underlying molecular target therapies.
Testi di riferimento/Textbooks
Biologia molecolare della cellula. Alberts B. ed. Zanichelli. Lavori scientifici pubblicati su riviste scientifiche forniti dal docente. Altro materiale fornito dal docente.
Molecular Biology of the cell. Alberts B. ed. Zanichelli. Papers published on peer reviewed journals provided by the teacher. Other material provided.
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone l'obiettivo di fornire allo studente le basi di conoscenza dei meccanismi molecolari d'azione dei farmaci a bersaglio molecolare.
The course aims to provide the student with the knowledge of the molecular mechanisms of action of targeted therapies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di biologia cellulare e molecolare
Basic knowledge of cellular and molecular biology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni teoriche ed esercitazioni mediante preparazione di presentazioni ppt e ricerche bibliografiche in pubmed. In caso di emergenza COVID-19, le lezioni e le esercitazioni saranno tenute in modalità telematica, nei tempi e nelle modalità concordate con i coordinatori dei corsi di studio.
Theoretical lectures and exercises with ppt presentation by students and searching of scientific articles in pubmed. In case of the COVID-19 emergency, the lessons will be held at a distance using e-learning technologies, according to the schedule and modality indicated by the administration.
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Visionare scheda dell’insegnamento generale.
see teaching overview shee
Programma esteso/Content
Recettori con attività enzimatica intrinseca, recettori accoppiati a proteine citosoliche, recettori accoppiati a proteine G, recettori nucleari, enzimi. Terapie oncologiche a bersaglio molecolare: azione sulla proliferazione cellulare, angiogenesi, senescenza, e apoptosi. Meccanismi di riparo di danni al DNA. Selezione dei pazienti che possono beneficiare delle terapie a bersaglio molecolare. Medicina di precisione.
Receptors with intrinsic enzymatic activity, receptors coupled with cytosolic proteins, G coupled receptors, nuclear receptors, enzymes. Targeted cancer therapies: action on cell proliferation, angiogenesis, senescence and apoptosis. Mechanisms of DNA repair. Selection of patients who can benefit from molecular target therapies. Precision medicine.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine dell'insegnamento dovrà essere dimostrata la conoscenza delle vie di trasduzione del segnale generato dall'interazione farmaco/ e il suo bersaglio. Dimostrare capacità di analisi di un articolo scientifico. Tali risultati di apprendimento attesi, declinati in accordo con i descrittori di Dublino, sono: CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: dimostrare conoscenze avanzate di biologia cellulare e molecolare. Comprendere i meccanismi alla base dello sviluppo dei tumori al fine di identificare bersagli molecolari e terapie di precisione. CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: applicare le conoscenze teoriche per analizzare meccanismi molecolari complessi. Risolvere problemi in ambito biomedico/molecolare e farmacologico AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Valutare in modo critico dati sperimentali. ABILITÀ COMUNICATIVE: comunicare concetti scientifici in modo chiaro e coerente, utilizzando una terminologia appropriata. Presentare e discutere gli argomenti del corso in modo logico, evidenziando collegamenti tra i diversi temi trattati. CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO Sviluppare strategie di apprendimento autonome per l’ampliamento continuo delle conoscenze. Prepararsi a studi avanzati o ad attività di ricerca nel campo della ricerca oncologica.
By the end of the course, students must demonstrate knowledge of the signal transduction pathways generated by drug/target interactions. They should be able to analyze a scientific article effectively. These expected learning outcomes, aligned with the Dublin descriptors, are as follows: KNOWLEDGE AND COMPREHENSION: Demonstrate advanced knowledge of cellular and molecular biology. Understand the mechanisms underlying tumor development to identify molecular targets and precision therapies. APPLYING KNOWLEDGE AND COMPREHENSION: Apply theoretical principles to analyze complex molecular mechanisms. Solve problems within biomedical, molecular, and pharmacological contexts. JUDGMENT AUTONOMY: Critically evaluate experimental data. COMMUNICATION SKILLS: Clearly and coherently communicate scientific concepts, using appropriate terminology. Present and discuss course topics logically, highlighting connections between different themes. LEARNING ABILITY: Develop autonomous learning strategies for continuous knowledge expansion. Prepare for advanced studies or research activities in the field of oncology research.
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (I): Target innovativi in oncologia e malattie immunomediate
Course ID
FA0297
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
PORTA Chiara
Teachers
Porta Chiara, Consonni Francesca Maria
CFU
5.0
Teaching duration (hours)
40.0
Individual study time
85.0
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Discussione dei nuovi approcci di immunoterapia in ambito oncologico, del microambiente tumorale e dei target prognostici e terapeutici più innovativi. Analisi dei meccanismi molecolari alla base della patogenesi delle principali malattie immuno-mediate e dei target verso cui sono diretti i farmaci innovativi biotecnologici in uso clinico e in sviluppo.
Discussion of new cancer immunotherapy approaches, tumor microenvironment and the most innovative prognostic and therapeutic targets. Analysis of the molecular mechanisms underlying the pathogenesis of the main immune-mediated diseases and of the molecules targeted by innovative biotechnological drugs that are in current clinical use and under development.
Testi di riferimento/Textbooks
• Immunologia Cellulare e molecolare, 9^ edizione. Autori: Abul Abbas Andrew H. Lichtman Shiv Pillai. • Patologia Generale e fisiopatologia, Tomo I, V edizione Pontieri, Russo Frati • Articoli scientifici selezionati pubblicati da riviste di alto livello sull'argomento • Le diapositive delle lezioni e materiale aggiuntivo come pubblicazioni scientifiche saranno disponibili per le studentesse e gli studenti.
• Immunologia Cellulare e molecolare, 9^ edizione. Autori: Abul Abbas Andrew H. Lichtman Shiv Pillai. • Patologia Generale e fisiopatologia, Tomo I, V edizione Pontieri, Russo Frati • Selected scientific papers published by top ranking journals on the topic • The slides of the lectures and additional material such as scientific publications will be available to students.
Obiettivi formativi/Mission
Acquisire e comprendere i target verso cui sono diretti i farmaci innovativi biotecnologici attualmente utilizzati per la cura dei tumori e delle principali malattie immuno-mediate. Applicare le conoscenze dei meccanismi molecolari alla base degli approcci di immunoterapia in ambito oncologico e le basi molecolari dell’eziopatogenesi delle principali malattie immuno-mediate per identificare nuovi potenziali target verso cui sviluppare farmaci biotecnologici innovativi. Sviluppare giudizio critico sulla materia, collegando logicamente tra loro concetti e conoscenze. Unire la capacità di apprendimento a quella divulgativa, ovvero sviluppare la capacità di discutere gli argomenti trattati in modo chiaro e fluente, utilizzando la terminologia appropriata. Comprendere i bersagli molecolari dei farmaci biotecnologici innovativi in uso clinico, in studio, o in sviluppo.
Knowledge and understanding the targets of innovative biotechnological drugs in current clinical use for the treatment of cancers and the main immune-mediated diseases. Applying knowledge and understanding of the molecular mechanisms underlying cancer immunotherapies and the etiopathogenesis of the main immune-mediated diseases to address new potential therapeutic targets and develop new biotechnological drugs. Gain independence of judgment on the different topics addressed during the course, logically linking concepts and knowledge together. Gain skills regarding the verbal and written communication by the use of specific scientific and technical language. Understanding of the molecular targets of innovative biotechnological drugs in current clinical use and under study
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di biologia cellulare, molecolare e immunologia
Basic knowledge of cell and molecular biology and immunology
Metodi didattici/Teaching methods
Le lezioni frontali saranno intervallate da metodi didattici attivi tipo “flipped classroom” basati sulla discussione di articoli scientifici. E' prevista anche la discussione obbligatoria, a gruppi o in singolo, di un articolo scientifico in modalità journal club, così da permettere alle studentesse e agli studenti di acquisire capacità nel presentare e discutere in maniera critica risultati scientifici. La presentazione verrà valutata con un punteggio che farà media con l'esito dell'esame orale.
Lectures as well as interactive flipped classroom methods based on journal club discussion. In particular, journal club discussion of a scientific article will also be carried out, in groups or individually. The presentation will be evaluated with a score that will be mediated with the score of the oral exam
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame finale consisterà in una prova orale; la/o studentessa/e sarà invitata/o a rispondere a domande aperte e sarà valutata/o per la comprensione della materia, l’utilizzo della terminologia scientifica appropriata, la capacità critica e divulgativa. Il voto dell'esame orale farà media con l'esito del journal club. Sono fissati 2 appelli per sessione nei mesi di febbraio, giugno-luglio, settembre.
Oral exam will consist of open questions aimed at assessing the understanding of the topic, the use of the specific scientific language, the making judgements and the communication skills. The oral exam score will be averaged with the journal club mark. Two exam sessions are scheduled during the months of February, June-July and September.
Programma esteso/Content
Ruolo del sistema immunitario in ambito oncologico. Immunogenicità dei tumori, classificazione degli antigeni tumorali. Cellule staminali tumorali Descrizione del microambiente tumorale e suo significato prognostico e clinico. Approcci usati per studiare il microambiente tumorale. Meccanismi alla base della relazione funzionale esistente tra infiammazione e tumori. Strategie anti-tumorali dirette a inibire l’angiogenesi. Strategie di immunoterapia in ambito oncologico: approcci basati su anticorpi diretti sulle cellule tumorali e sul microambiente, approcci basati sul trasferimento adottivo di cellule (CAR-T cells), approcci di vaccinazione profilattica (oncopatogeni) e terapeutica. Ruolo delle cellule mieloidi associate ai tumori nello sviluppo, nella prognosi e nella risposta alle terapie. Approcci diretti verso i macrofagi associati ai tumori (TAM) e le cellule soppressorie di derivazione mieloide (MDSC) Target metabolici e epigenetici diretti a modificare il microambiente tumorale. Impatto del microbiota sullo sviluppo e la risposta alle terapie convenzionali e agli approcci di immunoterapia Meccanismi alla base della tolleranza immunitaria e basi patologiche delle malattie autoimmuni. Reazioni di ipersensibilità di tipo I, II, III e IV. Patogenesi, opzioni terapeutiche attuali e nuovi potenziali target per le patologie immuno-mediate che interessano la cute (psoriasi, alopecia, vitiligine, dermatite atopica) il sistema gastrointestinale (malattie infiammatorie croniche intestinali, celiachia), le articolazioni (artrite reumatoide, artrite idiopatica giovanile, artrite psoriasica) e per quelle con un coinvolgimento sistemico (Lupus Eritematoso Sistemico)
Mechanisms underlying immune tolerance and pathological basis of autoimmune diseases. Type I, II, III and IV hypersensitivity reactions. Pathogenesis, current therapeutic options and new potential targets for the main immune-mediated diseases affecting the skin (psoriasis, alopecia, vitiligo, atopic dermatitis), the gastrointestinal system (inflammatory bowel disease, celiac disease), the joints (rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, psoriatic arthritis) and for those with systemic involvement (Systemic Lupus Erythematosus)
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Secondo i descrittori di Dublino: D1- CONOSCENZA E CAPACITA' DI COMPRENSIONE La/o studentessa/e dimostrerà di avere appreso e capito i target verso cui sono diretti i farmaci innovativi biotecnologici utilizzati per la cura dei tumori e delle principali malattie immuno-mediate. La/o studentessa/e dovrà padroneggiare la terminologia scientifica specifica. D2-CAPACITA' DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE La/o studentessa/e dimostrerà di essere in grado di applicare le conoscenze acquisite per poter 1) comprendere gli effetti terapeutici dei farmaci biotecnologici innovativi usati sia in ambito oncologico che per la cura delle malattie immuno-mediate 2) identificare nuovi potenziali target terapeutici 3) sviluppare nuovi farmaci diretti verso specifici bersagli molecolari/cellulari D3-AUTONOMIA DI GIUDIZIO La/o studentessa/e acquisirà conoscenze tali da permettergli di leggere in modo autonomo e critico la letteratura così da affrontare e risolvere i problemi legati al disegno e allo sviluppo di farmaci biotecnologici innovativi. D4-ABILITA' COMUNICATIVE La/o studentessa/e dimostrerà di essere capace di divulgare le conoscenze acquisite con proprietà lessicali specifiche così da potersi rapportare in modo professionale e competente sia in ambito accademico che industriale. La/o studentessa/e svilupperà l’abilità di trasmettere le conoscenze acquisite in modo chiaro e comprensibile anche a un pubblico di persone non esperte. D5-CAPACITA' DI APPRENDIMENTO La/o studentessa/e sarà capace di esaminare e interpretare i testi scientifici, così da andare oltre ciò che è stato insegnato, affrontando e risolvendo nuove sfide, ovvero identificando potenziali target per il disegno e lo sviluppo di farmaci biotecnologici innovativi
In keeping with the Dublin Descriptors D1- KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING: The student will demonstrate that he has learned and understood the molecules targeted by the innovative biotechnological drugs used for the treatment of cancers and the main immune-mediated diseases. The student will acquire the specific scientific terminology. D2- APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING The student will gain the ability to apply the acquired knowledge in order to 1) understand the therapeutic effects of innovative biotechnological drugs used both in oncology and for the treatment of immune-mediated diseases 2) identify new potential therapeutic targets 3) develop new drugs directed towards specific molecular/cell targets D3- MAKING JUDGEMENTS The student will gain knowledge to read the literature independently and critically, hence to figure out problems related to innovative biotechnological drug discovery and development D4- COMUNICATION SKILLS The student will demonstrate that he has acquired the specific scientific terminology to discuss the acquired knowledge both in the academic and industrial fields. The student will develop the ability to disseminate the acquired knowledge in a clear and understandable way even to an audience of non-experts D5- LEARNING SKILLS The student will be able to examine and interpret scientific texts, so as to go beyond what has been taught, facing and solving new challenges, identifying potential targets for the discovery and development of innovative biotechnological drugs
×
Print
Course
Lingua inglese
Course ID
FA0310
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
PARAVANO Cristina
Teachers
Paravano Cristina
CFU
4.0
Teaching duration (hours)
32.0
Individual study time
68.0
SSD
L-LIN/12 - LINGUA E TRADUZIONE - LINGUA INGLESE
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Inglese accademico (EAP-English for Academic Purposes) e inglese specifico per il corso di studi (ESP-English for Specific Purposes).
English for Academic Purposes (EAP) and English for Specific Purposes (ESP).
Testi di riferimento/Textbooks
Tamzen Armer, Cambridge English for Scientists, Cambridge, 2011. Grammar for Ielts, https://drive.google.com/file/d/0BxtaL881Sd6PTnowSmsyYzhwSzg/edit?resourcekey=0-dhvs8v9MnGc30aDHaOM1PQ
Tamzen Armer, Cambridge English for Scientists, Cambridge, 2011. Grammar for Ielts, https://drive.google.com/file/d/0BxtaL881Sd6PTnowSmsyYzhwSzg/edit?resourcekey=0-dhvs8v9MnGc30aDHaOM1PQ
Obiettivi formativi/Mission
Il corso intende sviluppare le abilità comunicative scritte e orali in ambito accademico, utilizzando un libro di testo specialistico e prendendo spunto da testi autentici. Il programma del corso e la modalità di valutazione fanno riferimento ad aree di competenza B2/B2+ del CEFR (Common European Framework of Reference).
The course aims to develop written and oral communication skills in the academic field, using a specialised textbook and authentic texts. The course programme and the mode of assessment are based on the B2/B2+ level of competence of the CEFR (Common European Framework of Reference).
Prerequisiti/Required background knowledge
Livello B2/B2+ del CEFR (Common European Framework of Reference).
B2/B2+ level of competence of the CEFR (Common European Framework of Reference).
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni interattive. Tutti i materiali didattici sono disponibili nella pagina del corso sulla piattaforma DIR che viene aggiornata regolarmente.
Interactive lectures. All course materials are available on the course page on the DIR platform, which is updated regularly.
Altre informazioni/Further information
La frequenza al corso è facoltativa ma vivamente consigliata.
Attendance is optional but strongly recommended.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame orale: Una presentazione orale su un argomento a scelta degli studenti collegato agli argomenti studiati durante il corso. La presentazione sarà valutata sulla correttezza grammaticale, sulla pronuncia, sull’ampiezza e appropriatezza del lessico e sulla coerenza e organizzazione del discorso. L’esame includerà anche domande orali sui contenuti del corso
Oral exam: An oral presentation on a topic of the students' choice related to the subjects studied in class. The presentation will be evaluated on grammatical accuracy, pronunciation, lexical range and appropriateness, and coherence and organization of the discourse. The exam will also include oral questions on the course content.
Programma esteso/Content
Durante le lezioni si svolgeranno le seguenti unità didattiche del libro di testo “Cambridge English for Scientists”: Unit 1 – Getting started in research Unit 2 – The scientific community Unit 3 – Finding a direction for your research Unit 4 – Designing an experiment Unit 5 – Describing an experiment Unit 6 – Writing up research 1: materials and methods Unit 7 – Writing up research 2: presenting data Unit 8 – Writing up research 3: results and discussion Unit 9 – Writing up research 4: introduction and abstract Unit 10 – Presenting research at a conference Per quanto riguarda gli esercizi di ascolto, gli audio sono disponibili nel CD incluso nel libro di testo. Inoltre, il libro di testo include le trascrizioni degli audio e le soluzioni degli esercizi.
The following units from the textbook “Cambridge English for Scientists” will be covered during the lessons : Unit 1 – Getting started in research Unit 2 – The scientific community Unit 3 – Finding a direction for your research Unit 4 – Designing an experiment Unit 5 – Describing an experiment Unit 6 – Writing up research 1: materials and methods Unit 7 – Writing up research 2: presenting data Unit 8 – Writing up research 3: results and discussion Unit 9 – Writing up research 4: introduction and abstract Unit 10 – Presenting research at a conference With regard to the listening exercises, the audios are available on the CD included in the book. In addition, the book includes transcripts of the audios and keys of the exercises.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli studenti saranno in grado di: - comprendere testi accademici; - utilizzare le strategie necessarie per organizzare testi accademici, in particolare presentazioni orali; - padroneggiare il lessico specialistico per discutere e presentare argomenti accademici.
Students will be able to: - understand academic texts; - use the strategies required to organise academic texts, and in particular oral presentations; - master specialist vocabulary for discussing and presenting academic topics.
×
Print
Course
Dal target al lead (II)
Course ID
FA0298
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MASSAROTTI Alberto
Teachers
Massarotti Alberto, Cora' Davide, Barberis Elettra, Miletto Ivana
CFU
13.0
Teaching duration (hours)
104.0
Individual study time
0.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA, BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE, CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA, CHIM/02 - CHIMICA FISICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso si propone di fornire alle studentesse e agli studenti una base solida nelle simulazioni computerizzate di entità chimiche come proteine e molecole. Inoltre, l'insegnamento mira a fornire conoscenze fondamentali sui metodi chimico-fisici utilizzati nello studio di sistemi biotecnologici di interesse farmaceutico. Sarà introdotta anche un'introduzione teorico-pratica alla bioinformatica e alla systems biology con un focus sull'applicazione di metodi omici nella ricerca biomedica in particolare nella farmacogenomica. Il corso coprirà anche i principi delle tecniche analitiche utilizzate nella proteomica e nella metabolomica inclusi gli indici di prestazione dei metodi analitici e i principi dell'uso di strumentazione come la cromatografia liquida e gas accoppiata alla spettrometria di massa. Saranno illustrate le differenze tra approccio "targeted" e "untargeted" e le strategie per scegliere l'approccio analitico più adatto a un problema pratico. Infine, le studentesse e gli studenti saranno guidati nella ricerca bibliografica e avranno l'opportunità di risolvere un caso studio proposto dalla docente.
The course aims to provide students with fundamental knowledge in computer simulation of chemical entities such as proteins and molecules. Additionally, it aims to provide essential knowledge of chemical and physical methods applicable to the study of biotechnological systems, particularly in the pharmaceutical field. The course also offers a theoretical and practical introduction to basic concepts of bioinformatics and systems biology commonly used in biomedical research, with a specific focus on studying the effects and characteristics of drugs using omics approaches (pharmacogenomics). Moreover, it introduces the principles of analytical techniques used in omics, specifically in proteomics and metabolomics. Performance indices of an analytical method (LOD, LOQ, accuracy and precision, robustness, etc.) will be introduced. The principles of liquid and gas chromatography coupled with mass spectrometry instruments and their applications in proteomics and metabolomics will be discussed. The differences between targeted and untargeted approaches and strategies for selecting the most suitable analytical approach for practical problems will be illustrated. Data handling will also be briefly addressed. Finally, students will be guided in conducting literature research and solving a case study proposed by the instructor.
Testi di riferimento/Textbooks
Vedere le schede dei singoli moduli.
Vedere le schede dei singoli moduli.
Obiettivi formativi/Mission
Conoscenze: Il corso si propone di fornire alle studentesse e agli studenti conoscenze fondamentali sui metodi di simulazione computerizzata per sistemi chimici e biologici. Ciò include tecniche computazionali per il calcolo delle energie e delle geometrie molecolari nonché l'analisi conformazionale di molecole piccole e macromolecole. Applicazione delle Conoscenze: Le studentesse e gli studenti svilupperanno la capacità di applicare le loro conoscenze per risolvere problemi chimici e biologici proposti durante il corso. Acquisiranno inoltre competenze nell'utilizzo di software di modellazione di base per prevedere la struttura delle proteine e le interazioni farmaco-recettore. Conoscenze e Comprensione: Il corso si concentra sullo sviluppo di una solida comprensione delle proprietà fisico-chimiche alla base dei metodi utilizzati nei sistemi biotecnologici, biologici e farmaceutici. Le studentesse e gli studenti impareranno a valutare e selezionare i metodi chimici e fisici appropriati per lo studio di sistemi specifici. Acquisiranno inoltre competenze di comunicazione inclusa l'uso di un vocabolario pertinente. Inoltre, impareranno ad analizzare in modo critico la letteratura e i casi studio.
Knowledge: The course aims to provide students with fundamental knowledge of computer simulation methods for chemical and biological systems. This includes computational techniques for energy and molecular geometry calculations, as well as conformational analysis of small molecules and macromolecules. Application of Knowledge: Students will develop the ability to apply their knowledge to solve chemical and biological problems presented during the course. They will also gain proficiency in using basic modeling software to predict protein structures and drug-receptor interactions. Knowledge and Understanding: The course focuses on developing a solid understanding of the physicochemical properties underlying the methods used in biotechnological, biological, and pharmaceutical systems. Students will learn to evaluate and select appropriate chemical and physical methods for studying specific systems. They will also acquire communication skills, including the use of relevant vocabulary. Additionally, they will learn to critically analyze literature and case studies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base in biologia molecolare, genetica, chimica generale ed inorganica, matematica e fisica.
Basic knowledge in molecular biology, genetics, general and inorganic chemistry, mathematics and physics.
Metodi didattici/Teaching methods
Vedere le schede dei singoli moduli.
See the description of the individual modules.
Altre informazioni/Further information
Vedere le schede dei singoli moduli.
See the description of the individual modules.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame riguarderà il contenuto dei moduli. Il voto finale sarà assegnato dalla commissione d'esame.
The exam will be about the content of the modules. The final grade will be decided by the exam commission.
Programma esteso/Content
Vedere le schede dei singoli moduli.
See the description of the individual modules.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso, le studentesse e gli studenti avranno acquisito una solida comprensione degli aspetti fondamentali necessari per condurre simulazioni accurate delle strutture chimico-biologiche. Le studentesse e gli studenti saranno in grado di applicare la conoscenza dei principali metodi chimico-fisici utilizzati nello studio di sistemi di interesse biotecnologico e farmaceutico, valutandone le potenzialità e l'applicabilità. Sarà richiesta ai partecipanti la conoscenza di strumenti bioinformatici di base per lo studio del genoma umano, in particolare nell'ambito biomedico e farmacogenomico. Saranno in grado di comprendere in modo autonomo e critico il contenuto di articoli di ricerca riguardanti argomenti e risultati bioinformatici e di biologia dei sistemi. Le studentesse e gli studenti acquisiranno conoscenze teoriche e pratiche sulle tecniche di analisi più moderne nel campo omico (cromatografia liquida e gas, spettrometria di massa) e sui metodi di pretrattamento e analisi dei campioni omici. Saranno in grado di confrontare diverse tecniche analitiche e di scegliere il metodo migliore per risolvere un caso studio. Inoltre, svilupperanno abilità comunicative utilizzando un vocabolario appropriato in relazione agli argomenti del corso e saranno in grado di organizzare e presentare un caso studio attraverso una presentazione in formato PowerPoint. Infine, svilupperanno autonomia di giudizio nel selezionare tra diverse tecniche per raggiungere uno stesso obiettivo.
At the end of the course, students will have acquired the fundamental aspects necessary for accurately simulating chemical and biological structures. Upon completion of the course, students will have gained knowledge of the main chemical and physical methods applicable to the study of biotechnological and pharmaceutical systems. They will be able to evaluate their potential and applicability. Students will have knowledge of basic bioinformatics tools for studying the human genome, particularly in the biomedical and pharmacogenomic fields. They will be able to autonomously and critically understand the content of research articles related to bioinformatics and systems biology. Knowledge and Understanding: understanding the theoretical and practical foundations of modern omics analysis techniques (liquid and gas chromatography, mass spectrometry), knowledge of sample pre-treatment and analysis methods in omics. Application of Knowledge and Understanding: being able to compare different analytical techniques, choosing the best method for solving a case study. Communication Skills: acquiring and using appropriate vocabulary related to the topics covered in the course, organizing and presenting a case study through a PowerPoint presentation. Judgment and Autonomy: the ability to choose among different techniques for the same purpose.
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
FA0299Modellistica molecolare CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA Massarotti Alberto Not available
FA0300Bioinformatica e approcci di systems biology BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE Cora' Davide Not available
FA0301Metodi analitici applicati alle scienze omiche CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA Barberis Elettra Not available
FA0302Metodi chimico fisici per le biotecnologie CHIM/02 - CHIMICA FISICA Miletto Ivana Not available
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (II): Modellistica molecolare
Course ID
FA0299
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MASSAROTTI Alberto
Teachers
Massarotti Alberto
CFU
5.0
Teaching duration (hours)
40.0
Individual study time
85.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso si propone di fornire allo studente le conoscenze fondamentali riguardanti la simulazione computerizzata di entità chimiche (proteine, molecole).
The aim of the course is to introduce the student to the main principles about computer simulation of chemical entities (compounds, proteins).
Testi di riferimento/Textbooks
Andreas Kukol, "Molecular Modeling of Proteins", English | 2014 | ISBN: 1493914642. https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-1465-4 Nathan Brown, "In Silico Medicinal Chemistry: Computational Methods to Support Drug Design", English | 2015 | ISBN: 978-1-78262-163-8. https://pubs.rsc.org/en/content/ebook/978-1-78262-163-8
Andreas Kukol, "Molecular Modeling of Proteins", English | 2014 | ISBN: 1493914642. https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-1465-4 Nathan Brown, "In Silico Medicinal Chemistry: Computational Methods to Support Drug Design", English | 2015 | ISBN: 978-1-78262-163-8. https://pubs.rsc.org/en/content/ebook/978-1-78262-163-8
Obiettivi formativi/Mission
1. Conoscenze. Alla fine del Corso gli studenti dovranno conoscere i principali metodi attualmente utilizzati nell'ambito della simulazione di sistemi di interesse chimico-biologico. In particolare, essi dovranno essere a conoscenza delle principali tecniche computazionali utili sia per il calcolo delle energie e delle geometrie molecolari, sia per l'analisi conformazionali di piccole (farmaci, ligandi endogeni) e macromolecole (proteine e acidi nucleici). 2. Capacità di applicare le conoscenze. Lo studente dovrà essere in grado di saper individuare la procedura più opportuna per risolvere alcuni problemi chimico-biologico che verranno proposti durante lo svolgimento del corso. Dovrà, inoltre, saper utilizzare alcuni software di modeling di base per prevedere la struttura tridimensionale proteica e l’associazione farmaco-recettore.
1. Knowledge. At the end of the course students will have to know the main methods currently used in the simulation of systems of chemical-biological interest. In particular, they must be aware of the main computational techniques useful both for the calculation of energies and molecular geometries, and for the conformational analysis of small (drugs, endogenous ligands) and macromolecules (proteins and nucleic acids). 2. Ability to apply knowledge. The student must be able to identify the most appropriate procedure to solve some chemical-biological problems that will be proposed during the course. He must also be able to use some basic modeling software to predict the three-dimensional protein structure and the drug-receptor association.
Prerequisiti/Required background knowledge
Nessuno
None
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso consiste in lezioni frontali con il supporto di slide che vengono fornite alle studentesse e agli studenti all'inizio del corso. Si presenteranno gli argomenti sia generali che specifici del corso fornendo le nozioni essenziali per la comprensione dell'argomento trattato e anche cercando di aprire discussioni con le studentesse e gli studenti. All’interno della pagina del corso sul D.I.R. (http://www.dir.uniupo.it) è attivo un forum per favorire la discussione condivisa (docente-studenti, studente-studenti) delle tematiche trattate nel corso. Le tematiche affrontate a lezione saranno oggetto di esercitazioni/simulazioni tramite l’utilizzo di programmi complessi di modellistica molecolare.
The course is given with the support of slides, which are given to the students at the beginning of the lessons. General and specific topics will be introduced, basic concepts will be provided for the understanding of each issue, and discussions with the students will be held. A forum section on the course page on D.I.R. (http://www.dir.uniupo.it) will help the discussions. The topics covered in class will be the subject of exercises/simulations through the use of complex molecular modeling programs.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo http://www.dir.uniupo.it Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further informations, please refer to the course page on D.I.R. at: http://www.dir.uniupo.it Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame consiste in un orale sugli argomenti trattati a lezione. La prima domanda può essere una breve presentazione di un case-study preparata precedentemente dove le studentesse e gli studenti dovranno dimostrare di conoscere principi e metodi (teoria e pratica) delle metodologie di modeling molecolare nonché di aver acquisito conoscenze di base sui metodi per la previsione della struttura proteica e delle interazioni farmaco-recettore.
The exam consists of an oral on the topics covered in class. The first question may be a short presentation of a case-study prepared previously where the student will have to demonstrate knowledge of principles and methods (theory and practice) of the modeling methodologies as well as having acquired basic knowledge on the methods for the presivione of the protein structure and drug-receptor interactions.
Programma esteso/Content
Metodi per il calcolo della geometria ed energia molecolare: Meccanica Molecolare. Metodi quantomeccanici (semi-empirici e ab initio, metodi DFT). I metodi misti Quantum Mechanics/ Molecular Mechanics per lo studio di sistemi molecolari e supramolecolari di grosse dimensioni. Utilizzo della densità elettronica e potenziale elettrostatico (MEP) per lo studio della similitudine e per il riconoscimento molecolare. Metodi di simulazione molecolare: Introduzione alla problematica della simulazione di molecole di interesse chimico-biologico. Dinamica Molecolare: metodi coarse grained e atomistici. Metodi di solvatazione. Alcuni esempi: solvatazione di ammino acidi e studio di una proteina in soluzione. Analisi conformazionale per molecole di interesse biologico: Metodi sistematici e metodi statistici (Monte Carlo). Il problema dell'analisi conformazionale per sistemi con un elevato numero di gradi di libertà. Applicazioni dei metodi: La modellistica delle molecole di interesse biologico- introduzione al drug design: metodi computazionali applicati alle biomolecole: Determinazione della struttura 3D di peptidi e proteine (metodi ab initio, Homology modeling e folding recognition). Applicazioni al modeling e design di peptidomimetici. La progettazione di un farmaco. Similitudine molecolare. Oligonucleotidi e acidi nucleici a singolo e doppio filamento ed il legame a ponte di idrogeno. Simulazioni di peptidi e proteine in bilayer lipidici: stato dell’arte ed esempi applicativi. Ricerca bibliografica e come si risolve un caso studio.
Methods for calculating geometry and molecular energy: Molecular Mechanics. Quantomechanical methods (semi-empirical and ab initio, DFT methods). Mixed Quantum Mechanics / Molecular Mechanics methods for the study of large molecular and supramolecular systems. Use of electron density and electrostatic potential (MEP) for the study of similarity and for molecular recognition. Molecular simulation methods: Introduction to the problem of simulating molecules of chemical-biological interest. Molecular dynamics: coarse grained and atomistic methods. Solvation methods. Some examples: solvation of amino acids and study of a protein in solution. Conformational analysis for molecules of biological interest: Systematic methods and statistical methods (Monte Carlo). The problem of conformational analysis for systems with a high number of degrees of freedom. Applications of the methods: Modeling of molecules of biological interest - introduction to drug design: computational methods applied to biomolecules: Determination of the 3D structure of peptides and proteins (ab initio methods, Homology modeling and folding recognition). Applications to modeling and design of peptidomimetics. The design of a drug. Molecular similarity. Oligonucleotides and single and double strand nucleic acids and the hydrogen bridge bond. Simulations of peptides and proteins in lipid bilayers: state of the art and application examples. Bibliographic research and how to solve a case study.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Le studentesse e gli studenti al termine del corso avranno appreso gli aspetti fondamentali necessari per simulare correttamente le strutture chimico-biologiche.
At the end of the course the student will have learned the fundamental aspects necessary to correctly simulate the chemical-biological structures.
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (II): Bioinformatica e approcci di systems biology
Course ID
FA0300
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
CORA' Davide
Teachers
Cora' Davide
CFU
3.0
Teaching duration (hours)
24.0
Individual study time
51.0
SSD
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
ITALIANO
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso vuole fornire un’introduzione teorico-pratica a concetti di base di bioinformatica e di systems biology di più comune utilizzo nell'ambito della ricerca biomedica, con particolare riferimento allo studio degli effetti e caratteristiche di farmaci con metodi omici (farmacogenomica).
The course will provide an introduction to examples of concepts and instruments at the foundation of bioinformatics and genomics, in the framework of human health and pharmacogenomics in particular.
Testi di riferimento/Textbooks
Il materiale didattico sarà rappresentato dalle slide usate a lezione e da articoli scientifici, i cui riferimenti saranno forniti durante le lezioni stesse. Sono poi consigliati i seguenti testi: Arthur Lesk, “Introduction to Bioinformatics”, Oxford University Press Arthur Lesk, “Introduction to Genomics”, Oxford University Press Deonier et al., “Computational Genome Analysis – An introduction”, ed Springer Andreas D. Baxevanis, Gary D. Bader, David S. Wishart, “Bioinformatics – fourth edition”, ed. John Wiley & Sons
Scientific papers and slides, provided during the lessons, will represent the main teaching materials. Further suggested books: Arthur Lesk, “Introduction to Bioinformatics”, Oxford University Press Arthur Lesk, “Introduction to Genomics”, Oxford University Press Deonier et al., “Computational Genome Analysis – An introduction”, ed Springer Andreas D. Baxevanis, Gary D. Bader, David S. Wishart, “Bioinformatics – fourth edition”, ed. John Wiley & Sons
Obiettivi formativi/Mission
Fornire una visione di base degli approcci bioinformatici e di systems biology di più comune utilizzo nell'ambito della ricerca biomedica, con particolare riferimento allo studio degli effetti e caratteristiche di farmaci con metodi omici. Fornire competenze di base per la lettura e interpretazione di articoli comprendenti contenuti bioinformatici e di systems biology.
Provide a basic view of the most commonly used bioinformatics and systems biology tools for the study of human health, with a focus in pharmacogenomics. Provide basic skills for reading and interpreting articles including bioinformatics content.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base in biologia molecolare e genetica.
Basic knowledge in molecular biology and genetics
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione frontale in aula e in aula informatica.
Lectures in classroom and computer classroom.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo http://www.dir.uniupo.it Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further informations, please refer to the course page on D.I.R. at: http://www.dir.uniupo.it Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Sono previste delle relazioni scritte su esperienze in-itinere e un esame finale scritto. L’esame scritto finale consisterà in una serie di domande a scelta multipla e aperte riguardanti tutti gli argomenti svolti durante il corso, inclusi articoli di ricerca discusso a lezione.
In-itinere written reports for a series of assignments (computer homeworks) and a final written exam. The final written exam will consist of a series of multiple-choice and open questions concerning all the topics covered during the course, including selected research articles.
Programma esteso/Content
Ripasso di concetti di base sulla struttura, organizzazione e funzionamento del genoma umano. Il database Ensembl, descrizione e funzionamento. Struttura di un gene umano in Ensembl, recupero di informazioni di sequenza, struttura proteica, annotazioni funzionali e cliniche. Il genome Browser UCSC, descrizione e funzionamento. Struttura di un gene umano in UCSC, recupero di informazioni funzionali e di espressione. Introduzione al Sequenziamento NGS. Metodo di sequenziamento Illumina. Introduzione alla metodologia RNA-seq. Design di un esperimento di RNA-seq e relativa analisi dati bioinformatica. Introduzione alla Systems Biology e alla teoria dei networks. Esempi di utilizzo della teoria dei networks per lo studio di dati biologici. Farmacogenomica. Esempi di database di interazione proteina-proteina e di iterazione farmaco-proteina. Esempi di uso del programma Cystoscape e del linguaggio di programmazione statistico R. Esempi di articoli di ricerca presenti su Pubmed in cui sono discussi argomenti attinenti alle problematiche affrontate durante il corso.
Review of basic concepts on the structure, organization and functioning of the human genome. The Ensembl database, description and operation. Structure of a human gene in Ensembl, sequence information retrieval, protein structure, functional and clinical annotations. The UCSC browser genome, description and operation. UCSC structure and annotation of a human gene, retrieval of functional and expression information. Introduction to NGS Sequencing. Illumina sequencing methodology. Introduction to RNA-seq methodology. Design of an RNA-seq experiment and related bioinformatics data analysis. Introduction to systems biology and network theory. Examples of networks in biology and genomics. Pharmacogenomics. Protein-protein and protein-drug interaction databases. Basic usage of the Cytoscape software and the R statistical programming language. Examples of research articles available on Pubmed discussing topics related to arguments related to the course.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli studenti dovranno avere conoscenza di alcuni strumenti bioinformatici di base per lo studio del genoma umano, in particolare in ambito biomedico e farmacogenomico. Essere in grado di comprendere in maniera autonoma e critica il contenuto di articoli di ricerca concernenti argomenti e risultati bioinformatici e di biologia dei sistemi.
It is expected an increased knowledge-based and personalized judgement capability on basic applied bioinformatics, in particular concerning the human genome and its biomedical applications, including pharmacogenomics. Being able to understand independently and critically the content of research articles concerning bioinformatics and systems biology topics and results.
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (II): Metodi analitici applicati alle scienze omiche
Course ID
FA0301
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
BARBERIS ELETTRA
Teachers
Barberis Elettra
CFU
2.0
Teaching duration (hours)
16.0
Individual study time
34.0
SSD
CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso ha lo scopo di introdurre i principi delle tecniche analitiche utilizzate in campo omico, con particolare riferimento alla proteomica e alla metabolomica. Saranno introdotti gli indici di prestazione di un metodo analitico (LOD, LOQ, esattezza e precisione, accuratezza, ripetibilità, riproducibilità, recupero, range dinamico e lineare, robustezza etc.). Saranno poi introdotti i principi della strumentazione per cromatografia liquida e gas, accoppiate a spettrometria di massa, e il loro utilizzo nel campo della proteomica e della metabolomica. Saranno illustrate le differenze tra approccio targeted e untargeted e le strategie per scegliere il migliore approccio analitico a fronte di un problema pratico. Si farà inoltre cenno al trattamento del dato. Infine, gli studenti saranno guidati nell’affrontare una ricerca bibliografica e risolvere un caso studio proposto dal docente.
The course aims to introduce the principles of analytical techniques used in the omic field, with particular reference to proteomics and metabolomics. The performance indexes of an analytical method (LOD, LOQ, accuracy and precision, accuracy, repeatability, reproducibility, recovery, dynamic and linear range, robustness etc.) will be introduced. The principles of instrumentation for liquid and gas chromatography, coupled with mass spectrometry, and their use in the field of proteomics and metabolomics will then be introduced. The differences between the targeted and untargeted approach and the strategies for choosing the best analytical approach for a practical problem will be illustrated. We will also mention the processing of the data. Finally, students will be guided in carrying out a bibliographic research and solving a case study proposed by the teacher.
Testi di riferimento/Textbooks
Copia delle slide fornite dal docente
Slides and material from the teacher
Obiettivi formativi/Mission
Il corso ha l'obiettivo di fornire allo studente conoscenze della più diffusa strumentazione analitica in campo omico (cromatografia liquida, gascromatografia, spettrometria di massa) e sui parametri per valutare la performance di un metodo analitico. Sono inoltre fornite conoscenze circa i metodi di pretrattamento del campione per analisi omiche. Lo studente acquisirà capacità di senso critico, affinando l’abilità di scegliere la miglior strategia sperimentale per risolvere un dato problema analitico. Saranno anche stimolate le capacità di comunicazione tramite un lessico appropriato e la proposta di casi studio che gli studenti dovranno risolvere e presentare tramite presentazione ppt.
The course aims to provide the student with knowledge of the most widespread analytical instrumentation in the omic field (liquid chromatography, gas chromatography, mass spectrometry) and on the parameters to evaluate the performance of an analytical method. Knowledge is also provided about the sample pretreatment methods for omic analysis. The student will acquire critical sense skills, honing the ability to choose the best experimental strategy to solve a given analytical problem. Communication skills will also be stimulated through an appropriate lexicon and the proposal of case studies that students will have to solve and present via ppt presentation.
Prerequisiti/Required background knowledge
Nessuno
None
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali o, in caso di perdurare dell’emergenza legata al COVID-19, video lezioni in modalità streaming e/o tramite video su canale dedicato YouTube.
Frontal lessons or, in the event of a persisting emergency related to COVID-19, video lessons in streaming mode and / or via video on a dedicated YouTube channel.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo http://www.dir.uniupo.it Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further informations, please refer to the course page on D.I.R. at: http://www.dir.uniupo.it Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame orale che consiste in: - una domanda sugli argomenti del corso che può riguardare: 1) la descrizione dei principi di una tecnica analitica; 2) la descrizione della strumentazione utilizzata in campo omico; 3) soluzione di un semplice problema analitico per il quale lo/a studente/ssa dovrà selezionare il miglior approccio analitico. - presentazione ppt di 5-10 minuti sul caso studio concordato col docente.
Oral exam consisting of: - a question on the topics of the course which may concern: 1) the description of the principles of an analytical technique; 2) the description of the instrumentation used in the omic field; 3) solution of a simple analytical problem for which the student must select the best analytical approach. - 5-10 minute ppt presentation on the case study agreed with the teacher.
Programma esteso/Content
Introduzione al corso. Indici di prestazione di un metodo analitico (LOD, LOQ, esattezza e precisione, accuratezza, ripetibilità, riproducibilità, recupero, range dinamico e lineare, robustezza etc.). Principi di base della strumentazione per cromatografia liquida e gas. Introduzione alle tecniche omiche. Utilizzo di tecniche cromatografiche (HPLC e GC) e il loro accoppiamento con la spettrometria di massa nelle scienze omiche. Proteomica targeted e untargeted. Metabolomica targeted e untargeted. Cenni su metodi di pre-trattamento del campione in campo omico. Cenni sul trattamento dei dati in campo omico. Strategie per identificare il miglior approccio analitico alla soluzione di un dato problema. Ricerca bibliografica e come si risolve un caso studio.
Introduction to the course. Performance indices of an analytical method (LOD, LOQ, accuracy and precision, accuracy, repeatability, reproducibility, recovery, dynamic and linear range, robustness etc.). Basic principles of instrumentation for liquid and gas chromatography. Introduction to omic techniques. Use of chromatographic techniques (HPLC and GC) and their coupling with mass spectrometry in the omic sciences. Targeted and untargeted proteomics. Targeted and untargeted metabolomics. Notes on methods of pre-treatment of the sample in the omic field. Notes on data treatment in the omic field. Strategies for identifying the best analytical approach to solving a given problem. Bibliographic research and how to solve a case study.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Conoscenza e comprensione - conoscenza delle basi teoriche e teorico/pratiche delle più moderne tecniche di analisi in campo omico (cromatografia liquida e gas, spettrometria di massa) - conoscenza dei metodi di pretrattamento e analisi di campioni in campo omico Capacità di applicare conoscenza e comprensione - saper confrontare diverse tecniche analitiche - saper scegliere il metodo migliore per la soluzione di un caso studio Abilità comunicative - acquisire e saper utilizzare un lessico appropriato in relazione agli argomenti affrontati nel corso - saper organizzare e presentare un caso studio tramite presentazione ppt Autonomia di giudizio - capacità di scegliere tra diverse tecniche analitiche per uno stesso scopo
Knowledge and understanding - knowledge of the theoretical and theoretical / practical bases of the most modern analysis techniques in the omic field (liquid and gas chromatography, mass spectrometry) - knowledge of pretreatment methods and analysis of samples in the omic field Ability to apply knowledge and understanding - know how to compare different analytical techniques - knowing how to choose the best method for the solution of a case study Communication skills - acquire and know how to use an appropriate lexicon in relation to the topics covered in the course - know how to organize and present a case study through ppt presentation Judgment autonomy - ability to choose between different analytical techniques for the same purpose
Show parent course details
×
Print
Course
Dal target al lead (II): Metodi chimico fisici per le biotecnologie
Course ID
FA0302
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MILETTO IVANA
Teachers
Miletto Ivana
CFU
3.0
Teaching duration (hours)
24.0
Individual study time
51.0
SSD
CHIM/02 - CHIMICA FISICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
L’insegnamento si propone di fornire allo studente le conoscenze fondamentali riguardanti i metodi chimico-fisici applicabili allo studio di sistemi di interesse biotecnologico, in particolare di interesse farmaceutico.
The course aims to provide students with the fundamental knowledge regarding the chemical-physical methods applicable to the study of systems of biotechnological interest, in particular of pharmaceutical interest.
Testi di riferimento/Textbooks
In aggiunta agli appunti ed al materiale fornito dal docente è utile la consultazione dei seguenti libri: Peter William Atkins, Julio de Paula “Elementi di chimica fisica” Zanichelli 2018 ISBN. 978-88-08-22068-4 Marc R. Roussel "A Life Scientist's guide to physical chemistry" Cambridge University Press ISBN 978-0-521-18696-4
In addition to the material provided by the lecturer, consulting the following is suggested: Peter William Atkins, Julio de Paula “Elementi di chimica fisica” Zanichelli 2018 ISBN. 978-88-08-22068-4 Marc R. Roussel "A Life Scientist's guide to physical chemistry" Cambridge University Press ISBN 978-0-521-18696-4
Obiettivi formativi/Mission
Conoscenze e capacità di comprensione: acquisire solide conoscenze degli aspetti fondamentali delle proprietà chimico-fisiche alla base dei metodi di studio di sistemi di interesse biotecnologico, biologico e farmaceutico. Conoscenze e capacità di comprensione applicate: acquisire la capacità di saper valutare, alla luce delle nozioni apprese durante il corso, quali siano i metodi chimico-fisici più idonei allo studio di determinati sistemi. Abilità comunicative: acquisire e saper utilizzare un lessico appropriato in relazione agli argomenti ed alle tecniche trattati nel corso. Autonomia di giudizio: saper analizzare in modo critico letteratura recente e casi studio.
Knowledge and understanding: knowledge of the fundamental aspects of the chemical-physical properties underlying the methods applicable to the study of systems of biotechnological, biological and pharmaceutical interest. Applying knowledge and understanding: acquire the ability to be able to evaluate, in the light of the notions learned during the course, which are the most suitable chemical-physical methods for the study of certain systems. Communication skills: acquire and know how to use an appropriate vocabulary in relation to the topics and techniques covered in the course. Making judgments: understand and critically analyze recent literature and case studies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di basi di chimica generale ed inorganica, matematica e fisica
Basic knowledge of general and inorganic chemistry, mathematics and physics
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione frontale con il supporto di slide messe a disposizione degli studenti mediante caricamento sulla pagina D.I.R. del corso. Lezione esercitazione / problem solving.
Lectures with the support of slides made available to students by uploading them to the D.I.R. of the course. Exercise / problem solving lesson.
Altre informazioni/Further information
All’inizio di ogni lezione viene ripresa la lezione precedente. L’apprendimento in itinere sarà valutato in aula mediante discussione con gli studenti e on-line mediante la somministrazione di questionari di feedback e test in itinere sulla piattaforma D.I.R. Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo http://www.dir.uniupo.it Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
At the beginning of each lesson, the previous lesson is resumed. Itinere learning will be evaluated in the classroom through discussion with students and online through the administration of feedback questionnaires and in itinere tests on the D.I.R. For further updated information, please consult the D.I.R. of the course. Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame consiste in una prova orale sugli argomenti trattati a lezione. Lo studente sarà valutato, oltre che sulla conoscenza degli argomenti, anche sulla capacità di argomentare, di collegare tra loro concetti e conoscenze, utilizzando una terminologia appropriata.
The exam consists of an oral test on the topics covered during the course. The student will be evaluated not only on the knowledge of the topics, but also on the ability to argue, to link concepts and knowledge together, using appropriate terminology.
Programma esteso/Content
Interazione radiazione-materia Spettroscopie elettroniche (assorbimento e fotoluminescenza, stazionaria, risolta nel tempo e anisotropia) sia su liquidi che su solidi (cenni a formulazioni ed additivi nanotecnologici e biotecnologici) Spettroscopie vibrazionali (IR e Raman) Dicroismo circolare Studio delle interfacce solido/liquido, solido/gas e liquido/liquido. Definizione di sistemi dispersi e sistemi colloidali. Classificazione in base alle dimensioni delle particelle disperse e tensione superficiale. Proprietà ottiche, elettriche e cinetiche dei sistemi colloidali e loro stabilità. Tecniche per lo studio delle dimensioni delle particelle nei sistemi dispersi: Dynamic Light Scattering (DLS) e Nanoparticles Tracking Analysis (NTA), microscopia ottica e microscopia elettronica in trasmissione (TEM) e a scansione (SEM). Microscopie a scansione di sonda. Tensioattivi e liposomi e loro proprietà chimico-fisiche. Nanomateriali e nanoparticelle per applicazioni biotecnologiche e biomedicali. Esempi di applicazioni di nanoparticelle in medicina: drug delivery e teranostica.
Radiation-matter interaction Electronic spectroscopies (absorption and photoluminescence, stationary, resolved over time and anisotropy) both on liquids and on solids (outline of nanotechnological and biotechnological formulations and additives) Vibrational spectroscopies (IR and Raman) Circular dichroism Study of the solid / liquid, solid / gas and liquid / liquid interfaces. Definition of dispersed systems and colloidal systems. Classification based on the size of the dispersed particles and surface tension. Optical, electrical and kinetic properties of colloidal systems and their stability. Techniques for studying particle sizes in dispersed systems: Dynamic Light Scattering (DLS), Nanoparticles Tracking analysis (NTA), optical microscopy, transmission electron microscopy (TEM) and scanning electron microscopy (SEM). Scanning Probe Microscopies. Surfactants and liposomes and their chemical-physical properties. Nanomaterials and nanoparticles for biotechnological and biomedical applications. Examples of applications of nanoparticles in medicine: drug delivery and theranostic.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso lo studente avrà acquisito la conoscenza dei principali metodi chimico-fisici applicabili allo studio di sistemi di interessi biotecnologico e farmaceutico e saprà valutarne le potenzialità e l’applicabilità.
At the end of the course the student will have acquired knowledge of the main chemical-physical methods applicable to the study of systems of biotechnological and pharmaceutical interests and will be able to evaluate their potential and applicability.
×
Print
Course
Patents, regulatory affairs, pharmacoeconomics and market access
Course ID
FA0309
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
JOMMI CLAUDIO
Teachers
Jommi Claudio, Poletti Simona, Meregaglia Michela
CFU
4.0
Teaching duration (hours)
32.0
Individual study time
68.0
SSD
SECS-P/07 - ECONOMIA AZIENDALE
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Annuale
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Modulo 1 (1 CFU): proprietà intellettuale. Questo modulo coprirà diversi argomenti: l’importanza della proprietà intellettuale e dei marchi, scopo dei brevetti, brevi cenni storici e definizioni, ricerche di anteriorità, novelty e inventiveness, la “persona esperta nella materia”, l’utilizzo dei database, deposito, esame, pubblicazione, registrazione, mantenimento, i “claim”, brevetto unitario, SPC waiver, classificazione dei brevetti nelle scienze farmaceutiche, i contenziosi legali. Verranno mostrati numerosi esempi. Modulo 2 (1 CFU): regolamentazione farmaceutica e accesso al mercato nei principali Paesi Europei. Questo modulo analizza le fasi di accesso al mercato dei farmaci: approvazione (con riferimento in particolare ad approvazione centralizzata, gestita dall'Agenzia Europea dei Medicinali) ed accesso al mercato (in particolare, prezzo e rimborso), con riferimento ai principali Paesi Europei. Modulo 3 (2 CFU): farmacoeconomia, Health Technology Assessment (HTA), accesso al mercato in Italia e per i farmaci ad alta complessità. Questo modulo descriverà (i) le principali metodologie che determinano il valore dei farmaci e i relativi prezzi, nell'ambito della valutazione comparativa delle tecnologie sanitarie (HTA); (ii) Il market access e prezzo e rimborso (P&R) in Italia; (iii) alcune aree critiche di accesso (es. malattie rare, contesti a basso reddito)
Module 1 (1 CFU): intellectual property. This module will deal with intellectual property protection, giving the student sufficient information to be able to undergo a prior art search, write a patent and evaluate the solidness of patents. The topics covered will be: the importance of intellectual property and trademarks, the scope of patents, brief history and definitions, prior art searches, novelty and inventiveness, the person skilled in the art, databases used, filing, examination, publication, approval, maintenance, claims, unitary patent, SPC waiver, classification of patents in the pharmaceutical sciences, litigations. Several examples will be shown. Module 2 (1 CFU): regulation of the pharmaceutical market and market access in the main European Countries. This module aims at describing the main phases of market access for pharmaceuticals: approval (with a specific focus on centralised marketing authorisation managed by the European Medicines Agency) and market access (mainly pricing and reimbursement) in the main European Markets. Module 3 (2 CFU): Pharmacoeconomics, Health Technology Assessment (HTA), Market Access in Italy and for critical drugs. This module will describe (i) the main methodologies that determine the drug value and the relevant prices, within a general overview on HTA; (ii) Market access and price and reimbursement (P&R) in Italy (iii) critical access areas (e.g., rare diseases, low-resource contexts)
Testi di riferimento/Textbooks
Letture specifiche
Ad hoc readings
Obiettivi formativi/Mission
Al termine del corso, la studentessa/lo studente apprende come proteggere gli esiti della ricerca e sviluppo dei farmaci; il ruolo degli affari regolatori e dei market access manager, delle agenzie regolatorie nazionali ed europee e le organizzazioni che negoziano il prezzo e rimborso dei farmaci. Inoltre, lo studente apprenderà le tecniche di valutazione economica applicata ai farmaci, nell'ambito dell'Health Technology Assessment (HTA).
At the end of the course, the student will understand how to protect the results of the research and development on medicines; will learn the role of regulatory affairs professionals and market access managers, and of national and European regulatory agencies and organisations that negotiate the price and reimbursement status of drugs. Moreover, the student will learn the techniques of economic evaluation applied to drugs within a Health Technology Assessment (HTA) approach.
Prerequisiti/Required background knowledge
Nessuno
None
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso prevede lezioni frontali in aula con proiezione di diapositive, applicazioni pratiche ed esercizi.
The course includes lectures in the classroom with slide projection, practical applications, and exercises.
Altre informazioni/Further information
Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti- disabili-e-dsa. Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services- students-physical-or-learning-disabilities. Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'accertamento del raggiungimento degli obiettivi previsti avviene attraverso l'esame finale, mediante un test a risposta multipla (32 domande) che include anche semplici esercizi. Il test accerterà la conoscenza delle principali modalità di registrazione dei farmaci, le dinamiche del mercato, le modalità di accesso e di negoziazione del prezzo e rimborso dei farmaci in prospettiva nazionale e internazionale. Infine, il test valuterà la conoscenza delle principali metodologie di analisi farmaco-economica e la conoscenza dei processi di HTA.
The achievement of the learning objectives will be assessed through a final multiple-choice test (32 questions) including also simple exercises. The test will assess the knowledge of the marketing authorisations procedures, market trends, market access, and price and reimbursement processes from a national and international perspective. Moreover, the test will assess the knowledge of the main pharmacoeconomic analysis techniques and the knowledge of HTA.
Programma esteso/Content
Modulo 1 (1 CFU): proprietà intellettuale. I diritti di proprietà intellettuale: brevi cenni al modello di utilità, disegno industriale, trademark, copyright. I brevetti: requisiti di brevettabilità. Il documento brevettuale. Le convenzioni internazionali di brevettazione e le strategie di brevettazione. Ricerca di prior art e freedom to operate. Modulo 2 (1 CFU): regolamentazione farmaceutica e accesso al mercato nei principali Paesi Europei. Introduzione al ruolo degli affari regolatori e del market access. Regolamentazione sui medicinali e principali linee guida internazionali. Tipologie di registrazione dei farmaci (nazionali ed europee). Il ruolo delle agenzie regolatorie. L'accesso al mercato in prospettiva internazionale e la negoziazione di prezzo e rimborso (P&R) nei principali Paesi Europei. Modulo 3 (2 CFU): Farmacoeconomia (introduzione alle analisi farmacoeconomiche), Health Technology Assessment (HTA), accesso al mercato in Italia e per i farmaci ad alta complessità. Prezzo e rimborso (P&R) in Italia. Accordi di rimborso condizionato (MEA). Politiche regionali e locali. Focus su farmaci orfani, terapie avanzate e personalizzate, malattie tropicali e accesso ai farmaci nei Paesi a medio e basso reddito. Disparità di accesso in base a variabili socio-economiche (es. reddito, genere, istruzione).
Module 1 (1CFU): intellectual property. Intellectual property rights: general information about utility model, industrial design, trademark, copyright. Patent and patentability. Claims and description. Patent convention and protection strategy. Prior art search and freedom to operate. Module 2 (1 CFU): regulation of the pharmaceutical market and market access in the main European Countries. Introduction to regulatory affairs and market access. Medicines regulation and main international guidelines. Types of drug approval (national and European). The role of regulatory agencies, Market access in the international perspective and price and reimbursement (P&R) negotiation in the main European Countries. Module 3 (2 CFU): Pharmacoeconomics (introduction to basic economic analyses), Health Technology Assessment (HTA), market access in Italy and for critical drugs. Price and reimbursement (P&R) in Italy. Managed Entry Agreements (MEAs). Regional and local policies. Focus on orphan drugs, medicines for advanced therapies (ATMPs) and personalized therapies, neglected tropical diseases and drug access in middle- and low- income countries. Inequalities in drug access according to socio-economic variables (e.g., income, gender, education).
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso la studentessa/lo studente conoscerà le principali normative, regolamentazioni e leggi applicate ai farmaci ad uso umano. Conoscerà le principali tecniche di analisi farmaco-economica e i processi di HTA, accesso al mercato e prezzo e rimborso (P&R) in prospettiva nazionale e internazionale.
At the end of the course, the student will know the main regulations and laws applied to drugs for human. Also, the student will know the main techniques of pharmacoeconomic analyses and the main HTA, market access and price and reimbursement (P&R) processes from a national and international perspective.
×
Print
Course
Introduction to Drug Nomenclature and INN
Course ID
FA0721
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MASSAROTTI Alberto
Teachers
Massarotti Alberto
CFU
1.0
Teaching duration (hours)
8.0
Individual study time
17.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OPZ
Course category
D
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso offre una panoramica completa sul sistema di nomenclatura internazionale per le sostanze farmaceutiche noto come International Nonproprietary Names (INN), sviluppato dall'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS).
The course provides a comprehensive overview of the international nomenclature system for pharmaceutical substances, known as International Nonproprietary Names (INN), developed by the World Health Organization (WHO).
Testi di riferimento/Textbooks
Il materiale di riferimento per il corso è disponibile sul sito ufficiale dell'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS). In particolare, i partecipanti possono consultare i documenti relativi al Programma INN, le linee guida per la nomenclatura e altre risorse correlate. Tutti i materiali sono accessibili gratuitamente e rappresentano la fonte principale per approfondire gli argomenti trattati. Link al sito OMS: https://www.who.int/teams/health-product-and-policy-standards/inn
The reference materials for the course are available on the official website of the World Health Organization (WHO). Participants can access documents related to the INN Programme, nomenclature guidelines, and other relevant resources. All materials are freely accessible and serve as the primary source for exploring the topics covered in the course. Link to WHO website: https://www.who.int/teams/health-product-and-policy-standards/inn
Obiettivi formativi/Mission
L’obiettivo del corso è fornire una comprensione approfondita della nomenclatura internazionale non proprietaria (INN) per le sostanze farmaceutiche. Attraverso un approccio teorico e pratico, il corso mira a: • Introdurre l’importanza della nomenclatura scientifica nel contesto farmaceutico. • Spiegare i principi e le regole che guidano la creazione degli INN. • Analizzare il processo di valutazione scientifica e linguistica per la denominazione dei farmaci. • Esplorare le applicazioni pratiche degli INN nell’industria farmaceutica, nei sistemi sanitari e nell’educazione dei professionisti della salute. Il corso intende sviluppare competenze tecniche e concettuali necessarie per interpretare, progettare e applicare correttamente gli INN, promuovendo al contempo una consapevolezza globale dell’importanza della standardizzazione nella nomenclatura farmaceutica.
The course aims to provide a comprehensive understanding of International Nonproprietary Names (INN) for pharmaceutical substances. Through a blend of theoretical and practical approaches, the course seeks to: • Introduce the significance of scientific nomenclature in the pharmaceutical context. • Explain the principles and rules that govern the creation of INNs. • Analyze the scientific and linguistic evaluation process for drug naming. • Explore practical applications of INNs in the pharmaceutical industry, healthcare systems, and health professionals' education. The course aspires to develop technical and conceptual skills necessary to interpret, design, and correctly apply INNs, while fostering global awareness of the importance of standardization in pharmaceutical nomenclature.
Prerequisiti/Required background knowledge
Nessuno
None
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso si svolge interamente online attraverso la piattaforma Moodle. Consiste in una serie di videolezioni che coprono i vari moduli tematici del programma. A supporto delle videolezioni, vengono forniti slides e materiali aggiuntivi per approfondire i contenuti trattati e consolidare l'apprendimento.
The course is conducted entirely online via the Moodle platform. It consists of a series of video lectures covering the various thematic modules of the program. Supporting materials, including slides and additional resources, are provided to deepen the topics covered and enhance learning.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=22352 Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further information, please refer to the course page on D.I.R. at: https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=22352 Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
La verifica dell’apprendimento avverrà attraverso esercitazioni pratiche e quiz di autovalutazione integrati nei moduli del corso. Ogni quiz è progettato per testare la comprensione dei concetti chiave presentati e l’applicazione delle regole e dei principi della nomenclatura INN. Non è previsto un esame finale. L’idoneità è determinata dal completamento con successo dei quiz di autovalutazione relativi ai singoli moduli.
Assessment will be conducted through practical exercises and self-assessment quizzes embedded within the course modules. Each quiz is designed to test the understanding of key concepts and the application of rules and principles of INN nomenclature. No final exam is required. Eligibility is determined by successfully completing the self-assessment quizzes for each module.
Programma esteso/Content
Il corso è strutturato in cinque moduli, ognuno dei quali affronta un aspetto specifico del sistema di nomenclatura INN (International Nonproprietary Names) e il suo impatto nell’industria farmaceutica, nella regolamentazione e nella pratica sanitaria. Introduzione al Programma INN Qualità delle sostanze farmaceutiche Creazione del Programma INN Obiettivi del Programma INN Coinvolgimento del Programma INN Principi scientifici della nomenclatura dei farmaci La nomenclatura nella scienza Il processo di scoperta dei farmaci Le basi scientifiche della nomenclatura dei farmaci Valutazione delle evidenze per il supporto Regole generali e principi della nomenclatura INN Approccio chimico alla nomenclatura INN Approccio a steli per la nomenclatura INN Principi generali per la definizione degli INN INN modificati e farmaci stereoisomerici Steli comuni per sostanze farmaceutiche Sviluppo di INN per sostanze biologiche e relative politiche di denominazione Processo di applicazione INN e protezione degli INN Processo operativo del Programma INN Modello del processo operativo Dal Proposed INN (pINN) al Recommended INN (rINN) Protezione degli INN Uso degli INN nell’industria farmaceutica, nei sistemi sanitari e nell’educazione Applicazioni pratiche degli INN nei diversi ambiti
The course is organized into five modules, each addressing a specific aspect of the INN (International Nonproprietary Names) system and its impact on the pharmaceutical industry, regulation, and healthcare practices. Introduction to the INN Programme Quality of pharmaceutical substances Establishing the INN Programme Objectives of the INN Programme INN Programme Engagement Scientific Principles of Drug Nomenclature Nomenclature in science The drug discovery process The scientific basis of drug nomenclature Evaluation of evidence for support General Rules and Principles of INN Nomenclature The chemical approach to INN nomenclature The stem approach to INN nomenclature General principles for devising INN Modified INN and stereoisomeric drugs Common stems for pharmaceutical substances Development of INN for biological substances and related naming policies INN Application Process and Protection of INN INN business process Business process model From Proposed INN (pINN) to Recommended INN (rINN) Protection of INN Use of INN in the Pharmaceutical Industry, Healthcare Systems, and Education Practical applications of INN across various fields
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso, gli studenti saranno in grado di: Comprendere l'importanza della nomenclatura scientifica e il ruolo degli International Nonproprietary Names (INN) nel contesto farmaceutico e sanitario. Conoscere le basi scientifiche e linguistiche utilizzate per la definizione degli INN e applicare i principi generali nella costruzione dei nomi. Identificare e utilizzare i criteri per la denominazione di farmaci chimici, biologici e terapie avanzate. Analizzare il processo di sviluppo, applicazione e protezione degli INN all'interno del programma della World Health Organization. Valutare l’impatto pratico degli INN in ambiti quali regolamentazione farmaceutica, marketing, educazione dei professionisti sanitari e pratica clinica.
At the end of the course, students will be able to: Understand the importance of scientific nomenclature and the role of International Nonproprietary Names (INN) in pharmaceutical and healthcare contexts. Gain knowledge of the scientific and linguistic foundations used for the definition of INN and apply general principles in naming construction. Identify and utilize criteria for naming chemical drugs, biological substances, and advanced therapies. Analyze the development, application, and protection process of INN within the World Health Organization programme. Assess the practical impact of INN in areas such as pharmaceutical regulation, marketing, health professionals' education, and clinical practice.
Course borrowed to
FARMACIA (A093) - FA0721 Introduction to Drug Nomenclature and INN - NOVARA
CHIMICA E TECNOLOGIA FARMACEUTICHE (A094) - FA0721 Introduction to Drug Nomenclature and INN - NOVARA
CHIMICA E TECNOLOGIA FARMACEUTICHE (1505) - FA0721 Introduction to Drug Nomenclature and INN - NOVARA
FARMACIA (1506) - FA0721 Introduction to Drug Nomenclature and INN - NOVARA
×
Print
Course
INN and Biological Active Substances
Course ID
FA0722
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MASSAROTTI Alberto
Teachers
Massarotti Alberto
CFU
1.0
Teaching duration (hours)
8.0
Individual study time
17.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OPZ
Course category
D
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso mira a fornire una comprensione dettagliata del processo di denominazione INN per le sostanze biologiche attive, incluse le proteine, gli anticorpi monoclonali e le terapie avanzate. Gli studenti acquisiranno conoscenze sui principi scientifici, sulle regole di nomenclatura e sull'importanza dell'uso degli INN nel settore sanitario e farmaceutico.
The course aims to provide a detailed understanding of the INN naming process for biological active substances, including proteins, monoclonal antibodies, and advanced therapies. Students will gain insights into the scientific principles, nomenclature rules, and the importance of INN usage in the healthcare and pharmaceutical sectors.
Testi di riferimento/Textbooks
Il materiale di riferimento per il corso è disponibile sul sito ufficiale dell'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS). In particolare, i partecipanti possono consultare i documenti relativi al Programma INN, le linee guida per la nomenclatura e altre risorse correlate. Tutti i materiali sono accessibili gratuitamente e rappresentano la fonte principale per approfondire gli argomenti trattati. Link al sito OMS: https://www.who.int/teams/health-product-and-policy-standards/inn
The reference materials for the course are available on the official website of the World Health Organization (WHO). Participants can access documents related to the INN Programme, nomenclature guidelines, and other relevant resources. All materials are freely accessible and serve as the primary source for exploring the topics covered in the course. Link to WHO website: https://www.who.int/teams/health-product-and-policy-standards/inn
Obiettivi formativi/Mission
Il corso ha l’obiettivo di fornire una comprensione approfondita del processo di denominazione per le sostanze biologicamente attive secondo il programma INN dell’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS). I partecipanti apprenderanno le politiche generali, gli schemi di denominazione e le regole applicate ai medicinali biologici complessi, alle proteine, agli anticorpi monoclonali e alle terapie avanzate. Il corso esplorerà inoltre le politiche specifiche per la denominazione dei vaccini e delle tecnologie innovative, incluse le terapie geniche e cellulari.
The course aims to provide an in-depth understanding of the naming process for biologically active substances under the WHO’s International Nonproprietary Name (INN) Programme. Participants will learn about general policies, naming schemes, and rules applied to complex biological medicines, proteins, monoclonal antibodies, and advanced therapies. The course also explores specific naming policies for vaccines and innovative technologies, including gene and cell therapies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Suggerito: FA0721 - Introduction to Drug Nomenclature and INN
Suggestion: FA0721 - Introduction to Drug Nomenclature and INN
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso si svolge interamente online attraverso la piattaforma Moodle. Consiste in una serie di videolezioni che coprono i vari moduli tematici del programma. A supporto delle videolezioni, vengono forniti slides e materiali aggiuntivi per approfondire i contenuti trattati e consolidare l'apprendimento.
The course is conducted entirely online via the Moodle platform. It consists of a series of video lectures covering the various thematic modules of the program. Supporting materials, including slides and additional resources, are provided to deepen the topics covered and enhance learning.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=22355 Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further information, please refer to the course page on D.I.R. at: https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=22355 Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
La verifica dell’apprendimento avverrà attraverso esercitazioni pratiche e quiz di autovalutazione integrati nei moduli del corso. Ogni quiz è progettato per testare la comprensione dei concetti chiave presentati e l’applicazione delle regole e dei principi della nomenclatura INN. Non è previsto un esame finale. L’idoneità è determinata dal completamento con successo dei quiz di autovalutazione relativi ai singoli moduli.
Assessment will be conducted through practical exercises and self-assessment quizzes embedded within the course modules. Each quiz is designed to test the understanding of key concepts and the application of rules and principles of INN nomenclature. No final exam is required. Eligibility is determined by successfully completing the self-assessment quizzes for each module.
Programma esteso/Content
Il corso è suddiviso in sette moduli: 1. Introduzione alle sostanze biologicamente attive e al programma INN: o Definizione di farmaci biologici. o Esempi di medicinali biologici. o Sfide e descrizioni specifiche per i biologici nel contesto INN. 2. Proteine e altre sostanze biologiche complesse: o Politiche generali per sostanze non glicosilate. o Sostanze glicosilate, proteine di fusione e sostanze transgeniche. o Politiche di denominazione per proteine coniugate e sostanze PEGilate. 3. Anticorpi monoclonali – Schema di denominazione tradizionale: o Politiche e sfide legate agli anticorpi monoclonali. o Evoluzione dello schema di denominazione. 4. Anticorpi monoclonali – Nuovo schema di denominazione: o Definizione e applicazione dei nuovi suffissi (-tug, -bart, -ment, -mig). 5. Terapie avanzate: o Nomenclatura per terapie geniche e cellulari. o Regole di denominazione per componenti genici, vettoriali e virali. o Nuove regole per terapie cellulari autologhe e terapie basate su virus. 6. Vaccini: o Politiche di denominazione per proteine terapeutiche e vaccini ricombinanti. o Tecnologie innovative, incluse le terapie mRNA.
The course is divided into seven modules: 1. Introduction to Biologically Active Substances and the INN Programme: o Definition of biological medicines. o Examples of biological medicines. o Challenges and specific descriptions for biologicals within the INN framework. 2. Proteins and Other Complex Biological Substances: o General policies for non-glycosylated substances. o Glycosylated substances, fusion proteins, and transgenic substances. o Naming policies for conjugated and PEGylated proteins. 3. Monoclonal Antibodies – Traditional Naming Scheme: o Policies and challenges related to monoclonal antibodies. o Evolution of the naming scheme. 4. Monoclonal Antibodies – New Naming Scheme: o Definition and application of new suffixes (-tug, -bart, -ment, -mig). 5. Advanced Therapies: o Nomenclature for gene and cell therapies. o Naming rules for gene, vector, and virus-based components. o New rules for autologous cell-based therapies and virus-based therapies. 6. Vaccines: o Naming policies for recombinant therapeutic proteins and vaccines. o Innovative technologies, including mRNA therapies.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso, gli studenti saranno in grado di: • Comprendere i principi scientifici e le regole per la denominazione degli INN per sostanze biologiche. • Analizzare casi specifici di proteine, anticorpi monoclonali e terapie avanzate. • Applicare le regole di denominazione a nuovi contesti nel settore farmaceutico.
By the end of the course, students will be able to: • Understand the scientific principles and rules for naming INN for biological substances. • Analyze specific cases of proteins, monoclonal antibodies, and advanced therapies. • Apply naming rules to new contexts in the pharmaceutical field.
Course borrowed to
FARMACIA (A093) - FA0722 INN and Biological Active Substances - NOVARA
CHIMICA E TECNOLOGIA FARMACEUTICHE (A094) - FA0722 INN and Biological Active Substances - NOVARA
CHIMICA E TECNOLOGIA FARMACEUTICHE (1505) - FA0722 INN and Biological Active Substances - NOVARA
FARMACIA (1506) - FA0722 INN and Biological Active Substances - NOVARA
×
Print
Course
VISUALIZZAZIONE MOLECOLARE
Course ID
FA0100
Academic Year
2025/2026
Year of rule
2025/2026
Degree
BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Curriculum
GENERICO
Teaching leader
MASSAROTTI Alberto
Teachers
Massarotti Alberto
CFU
2.0
Teaching duration (hours)
16.0
Individual study time
34.0
SSD
CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OPZ
Course category
D
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Italiano
Italian
Contenuti/Content Summary
Il corso si propone di fornire alla studentessa e allo studente le conoscenze fondamentali riguardanti la visualizzazione grafica di entità chimiche (proteine, molecole).
The aim of the course is to introduce the student to the main principles of molecular visualization of chemical entities (compounds, proteins).
Testi di riferimento/Textbooks
Dispense fornite a lezione.
The course is given with the support of slides.
Obiettivi formativi/Mission
Conoscenze e capacità di comprensione: Al termine del corso la studentessa e lo studente conosceranno e comprenderanno i concetti base della visualizzazione molecolare, in particolare saranno istruiti sulle tecniche utilizzate per supportare il drug design. Capacità di applicare le conoscenze e la comprensione: La studentessa e lo studente saranno in grado di applicare le conoscenze e la comprensione acquisite al riconoscimento delle strutture chimiche nello spazio 3D, alla discussione delle loro interazioni e alla loro rappresentazione grafica. Gestione delle conoscenze acquisite: La studentessa e lo studente saranno in grado di esprimere giudizi relativi alle strutture 3D di molecole e proteine, utilizzando gli strumenti necessari per la valutazione critica delle figure negli articoli scientifici. Abilità nella comunicazione: La studentessa e lo studente sapranno illustrare in modo originale una molecola o una proteina utilizzando i software trattati a lezione. Capacità di apprendere: La studentessa e lo studente impareranno a gestire in modo dinamico e autonomo le conoscenze sulla struttura di molecole e proteine.
Knowledge and understanding: At the end of the course, the student will know and understand the basic concepts of molecular visualization, in particular, the student will be instructed on the techniques used to support drug design. Ability to apply knowledge and understanding: The student will be able to apply the knowledge and understanding gained to the recognition of chemical structures in 3D space, the discussion of their interactions, and their graphic representation. Management of acquired knowledge: The student will be able to express judgments relating to the 3D structures of molecules and proteins, using the necessary tools for the critical evaluation of figures in scientific articles. Communication skills: The student will be able to explain in an original way a molecule or protein using the software covered in class. Learning ability: The student will learn to dynamically and independently manage their knowledge of the structure of molecules and proteins.
Prerequisiti/Required background knowledge
E’ consigliata allo studente una buona conoscenza di biologia generale, biochimica, farmacologia generale, e chimica farmaceutica.
Good knowledge in general biology, biochemistry, general pharmacology, and medicinal chemistry is strongly recommended.
Metodi didattici/Teaching methods
Il corso consiste in lezioni frontali con il supporto di slide che vengono fornite agli studenti all'inizio del corso. Si presenteranno gli argomenti sia generali che specifici del corso, fornendo le nozioni essenziali per la comprensione dell'argomento trattato e, anche cercando di aprire discussioni con gli studenti. All’interno della pagina del corso sul D.I.R. (http://www.dir.uniupo.it) è attivo un forum per favorire la discussione condivisa (docente-studenti, studente-studenti) delle tematiche trattate nel corso.
The course consists of lectures with the support of slides provided to the students at the beginning of the course. General and specific topics will be introduced, providing basic concepts for understanding each issue and encouraging discussions with students. A forum section on the course page on D.I.R. (http://www.dir.uniupo.it) will help the discussions.
Altre informazioni/Further information
Per ulteriori informazioni, si prega di consultare la pagina del corso su D.I.R. all'indirizzo http://www.dir.uniupo.it Le studentesse e gli studenti con disabilità o con Disturbi Specifici dell’Apprendimento (DSA) o con Bisogni Educativi Speciali (BES) possono richiedere servizi e strumenti specifici a loro dedicati rivolgendosi allo Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti e consultando la pagina dedicata del sito di Ateneo: https://uniupo.it/it/servizi/servizi-studenti-disabili-e-dsa Le studentesse e gli studenti con disabilità, DSA, BES, una volta preso contatto con lo Staff di Ateneo, possono contattare la/il docente titolare dell'insegnamento in relazione alla declinazione delle modalità di esame, in merito agli aspetti didattici.
For further information, please refer to the course page on D.I.R. at: http://www.dir.uniupo.it Students with physical disabilities, Learning Disabilities or Special Education Needs can request specific services and tools via the Staff Sviluppo e Coordinamento Carriere e Servizi alle Studentesse e agli Studenti, consulting the University webpage: https://www.uniupo.it/en/services/services-students-physical-or-learning-disabilities Students with disabilities, learning disabilities or special education needs, once they have contacted the University Staff, can refer to the tutor in charge of the course to define the examination modalities, concerning academic aspects.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Prova pratica in aula informatica con discussione orale dei risultati: la studentessa e lo studente dovranno dimostrare di saper creare una visualizzazione molecolare utilizzando le tecniche affrontate nel corso.
The final exam will be focused on a practical exercise with oral discussion. The exam aims at verifying the ability to create a figure of molecules using the knowledge learned in this course.
Programma esteso/Content
Il corso di “Visualizzazione molecolare” è finalizzato a descrivere i programmi e le tecniche di interesse in campo scientifico per una corretta divulgazione di dati complessi quali le strutture molecolari. I temi trattati saranno i seguenti: • Storia della rappresentazione delle molecole • Database di riferimento per strutture di composti organici e proteine • Programmi più diffusi per la visualizzazione molecolare • Scaricare, caricare e visualizzazione base di un modello • Interazione con i modelli molecolari nello spazio virtuale • Misurazione delle caratteristiche molecolari • Proprietà superficiali • Analisi delle interazioni proteina-inibitore • Allineamento 3D di strutture • Creazione di immagini ad alta definizione • Gestione delle raffigurazioni multiple (o scene) • Creazione di animazioni • Editing molecolare • Scripting
The topics will be: • History of the representation of the molecules • Database for structures of organic compounds and proteins • Most popular programs for molecular visualization • Download, upload and basic display of a model • Interaction with the molecular models in a virtual space • Measurement of molecular characteristics • Surface properties • Analysis of the protein-inhibitor interactions • Alignment of 3D structures • Create high-definition images • Managing multiple representations (or scenes) • Creating animations • Molecular Editing • Scripting
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
La studentessa e lo studente al termine del corso avranno appreso gli aspetti fondamentali necessari per rappresentare correttamente le strutture chimico-biologiche.
At the end of the course, the student will acquire theoretical knowledge and understanding about how to better depict chemical-biological structures.
Course borrowed from
FARMACIA (A093) - FA0100 VISUALIZZAZIONE MOLECOLARE - NOVARA
Print guide
Print
Year Course ID Course Teachers SSD Curriculum Site CFU
1 FA0306 Biotechnological drugs and vaccines: from design to marketing D'angelo Igor Edmondo Paolo, Pessolano Emanuela, Tron Gian Cesare BIO/14, CHIM/08 All NOVARA 7.0
1 FA0310 ENGLISH Paravano Cristina L-LIN/12 All NOVARA 4.0
1 FA0722 INN and Biological Active Substances Massarotti Alberto CHIM/08 All NOVARA 1.0
1 FA0721 Introduction to Drug Nomenclature and INN Massarotti Alberto CHIM/08 All NOVARA 1.0
1 FA0309 Patents, regulatory affairs, pharmacoeconomics and market access Jommi Claudio, Poletti Simona, Meregaglia Michela SECS-P/07 All NOVARA 4.0
1 FA0303 Structure, properties and engineering of biomolecules Miggiano Riccardo, Digilio Giuseppe BIO/10, CHIM/03 All NOVARA 13.0
1 FA0294 Target to lead (I) Distasi Carla, Tapella Laura Paola Ferilde, Lim Dmitry, Pinton Giulia, Porta Chiara, Consonni Francesca Maria BIO/09, BIO/13, MED/04 All NOVARA 15.0
1 FA0298 Target to lead (II) Massarotti Alberto, Cora' Davide, Barberis Elettra, Miletto Ivana CHIM/08, BIO/11, CHIM/01, CHIM/02 All NOVARA 13.0
1 FA0100 VISUALIZZAZIONE MOLECOLARE Massarotti Alberto CHIM/08 All NOVARA 2.0
Data synched: 16/07/2026, 04:25